Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZU67

BEND4, BEN domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEND4Q6ZU67 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
BEND4Q6ZU67 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
BEND4Q6ZU67 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
BEND4Q6ZU67 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
BEND4Q6ZU67 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
BEND4Q6ZU67 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
BEND4Q6ZU67 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
BEND4Q6ZU67 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
BEND4Q6ZU67 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
BEND4Q6ZU67 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
BEND4Q6ZU67 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
BEND4Q6ZU67 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
BEND4Q6ZU67 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
BEND4Q6ZU67 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
BEND4Q6ZU67 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
BEND4Q6ZU67 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
BEND4Q6ZU67 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
BEND4Q6ZU67 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
BEND4Q6ZU67 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
BEND4Q6ZU67 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
BEND4Q6ZU67 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
BEND4Q6ZU67 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
BEND4Q6ZU67 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
BEND4Q6ZU67 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
BEND4Q6ZU67 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
BEND4Q6ZU67 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
BEND4Q6ZU67 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
BEND4Q6ZU67 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
BEND4Q6ZU67 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
BEND4Q6ZU67 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
BEND4Q6ZU67 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
BEND4Q6ZU67 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
BEND4Q6ZU67 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
BEND4Q6ZU67 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
BEND4Q6ZU67 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
BEND4Q6ZU67 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
BEND4Q6ZU67 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
BEND4Q6ZU67 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
BEND4Q6ZU67 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
BEND4Q6ZU67 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
BEND4Q6ZU67 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
BEND4Q6ZU67 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
BEND4Q6ZU67 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
BEND4Q6ZU67 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
BEND4Q6ZU67 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
BEND4Q6ZU67 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
BEND4Q6ZU67 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
BEND4Q6ZU67 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
BEND4Q6ZU67 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
BEND4Q6ZU67 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
BEND4Q6ZU67 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
BEND4Q6ZU67 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
BEND4Q6ZU67 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
BEND4Q6ZU67 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
BEND4Q6ZU67 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
BEND4Q6ZU67 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
BEND4Q6ZU67 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
BEND4Q6ZU67 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
BEND4Q6ZU67 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
BEND4Q6ZU67 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
BEND4Q6ZU67 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
BEND4Q6ZU67 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
BEND4Q6ZU67 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
BEND4Q6ZU67 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
BEND4Q6ZU67 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
BEND4Q6ZU67 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
BEND4Q6ZU67 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
BEND4Q6ZU67 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
BEND4Q6ZU67 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
BEND4Q6ZU67 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
BEND4Q6ZU67 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
BEND4Q6ZU67 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
BEND4Q6ZU67 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
BEND4Q6ZU67 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
BEND4Q6ZU67 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
BEND4Q6ZU67 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
BEND4Q6ZU67 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
BEND4Q6ZU67 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
BEND4Q6ZU67 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
BEND4Q6ZU67 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
BEND4Q6ZU67 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
BEND4Q6ZU67 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
BEND4Q6ZU67 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
BEND4Q6ZU67 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
BEND4Q6ZU67 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
BEND4Q6ZU67 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
BEND4Q6ZU67 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
BEND4Q6ZU67 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
BEND4Q6ZU67 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
BEND4Q6ZU67 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
BEND4Q6ZU67 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
BEND4Q6ZU67 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
BEND4Q6ZU67 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
BEND4Q6ZU67 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
BEND4Q6ZU67 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
BEND4Q6ZU67 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
BEND4Q6ZU67 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
BEND4Q6ZU67 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
BEND4Q6ZU67 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
BEND4Q6ZU67 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms