Protein–RNA interactions for Protein: Q6UX01

LMBR1L, Protein LMBR1L, humanhuman

Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMBR1LQ6UX01 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LMBR1LQ6UX01 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LMBR1LQ6UX01 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LMBR1LQ6UX01 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LMBR1LQ6UX01 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LMBR1LQ6UX01 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LMBR1LQ6UX01 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LMBR1LQ6UX01 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
LMBR1LQ6UX01 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LMBR1LQ6UX01 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LMBR1LQ6UX01 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LMBR1LQ6UX01 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LMBR1LQ6UX01 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LMBR1LQ6UX01 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LMBR1LQ6UX01 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
LMBR1LQ6UX01 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LMBR1LQ6UX01 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LMBR1LQ6UX01 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LMBR1LQ6UX01 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LMBR1LQ6UX01 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LMBR1LQ6UX01 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LMBR1LQ6UX01 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LMBR1LQ6UX01 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LMBR1LQ6UX01 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LMBR1LQ6UX01 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LMBR1LQ6UX01 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LMBR1LQ6UX01 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
LMBR1LQ6UX01 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LMBR1LQ6UX01 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LMBR1LQ6UX01 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LMBR1LQ6UX01 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LMBR1LQ6UX01 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LMBR1LQ6UX01 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LMBR1LQ6UX01 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LMBR1LQ6UX01 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LMBR1LQ6UX01 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LMBR1LQ6UX01 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LMBR1LQ6UX01 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LMBR1LQ6UX01 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LMBR1LQ6UX01 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LMBR1LQ6UX01 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LMBR1LQ6UX01 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LMBR1LQ6UX01 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LMBR1LQ6UX01 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LMBR1LQ6UX01 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LMBR1LQ6UX01 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LMBR1LQ6UX01 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LMBR1LQ6UX01 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LMBR1LQ6UX01 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LMBR1LQ6UX01 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LMBR1LQ6UX01 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LMBR1LQ6UX01 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LMBR1LQ6UX01 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LMBR1LQ6UX01 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LMBR1LQ6UX01 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LMBR1LQ6UX01 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LMBR1LQ6UX01 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LMBR1LQ6UX01 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LMBR1LQ6UX01 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LMBR1LQ6UX01 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LMBR1LQ6UX01 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LMBR1LQ6UX01 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LMBR1LQ6UX01 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LMBR1LQ6UX01 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LMBR1LQ6UX01 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LMBR1LQ6UX01 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
LMBR1LQ6UX01 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LMBR1LQ6UX01 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LMBR1LQ6UX01 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LMBR1LQ6UX01 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
LMBR1LQ6UX01 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LMBR1LQ6UX01 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LMBR1LQ6UX01 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LMBR1LQ6UX01 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LMBR1LQ6UX01 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LMBR1LQ6UX01 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LMBR1LQ6UX01 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LMBR1LQ6UX01 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
LMBR1LQ6UX01 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LMBR1LQ6UX01 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LMBR1LQ6UX01 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
LMBR1LQ6UX01 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LMBR1LQ6UX01 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LMBR1LQ6UX01 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LMBR1LQ6UX01 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LMBR1LQ6UX01 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LMBR1LQ6UX01 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LMBR1LQ6UX01 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LMBR1LQ6UX01 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LMBR1LQ6UX01 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LMBR1LQ6UX01 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LMBR1LQ6UX01 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LMBR1LQ6UX01 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LMBR1LQ6UX01 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LMBR1LQ6UX01 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
LMBR1LQ6UX01 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LMBR1LQ6UX01 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
LMBR1LQ6UX01 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LMBR1LQ6UX01 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
LMBR1LQ6UX01 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms