Protein–RNA interactions for Protein: Q6QNY1

BLOC1S2, Biogenesis of lysosome-related organelles complex 1 subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BLOC1S2Q6QNY1 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
BLOC1S2Q6QNY1 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
BLOC1S2Q6QNY1 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
BLOC1S2Q6QNY1 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
BLOC1S2Q6QNY1 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
BLOC1S2Q6QNY1 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
BLOC1S2Q6QNY1 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
BLOC1S2Q6QNY1 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
BLOC1S2Q6QNY1 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
BLOC1S2Q6QNY1 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
BLOC1S2Q6QNY1 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
BLOC1S2Q6QNY1 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
BLOC1S2Q6QNY1 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
BLOC1S2Q6QNY1 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
BLOC1S2Q6QNY1 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
BLOC1S2Q6QNY1 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
BLOC1S2Q6QNY1 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
BLOC1S2Q6QNY1 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
BLOC1S2Q6QNY1 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
BLOC1S2Q6QNY1 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
BLOC1S2Q6QNY1 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
BLOC1S2Q6QNY1 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
BLOC1S2Q6QNY1 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
BLOC1S2Q6QNY1 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
BLOC1S2Q6QNY1 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
BLOC1S2Q6QNY1 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
BLOC1S2Q6QNY1 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
BLOC1S2Q6QNY1 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
BLOC1S2Q6QNY1 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
BLOC1S2Q6QNY1 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
BLOC1S2Q6QNY1 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
BLOC1S2Q6QNY1 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
BLOC1S2Q6QNY1 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
BLOC1S2Q6QNY1 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
BLOC1S2Q6QNY1 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
BLOC1S2Q6QNY1 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
BLOC1S2Q6QNY1 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
BLOC1S2Q6QNY1 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
BLOC1S2Q6QNY1 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
BLOC1S2Q6QNY1 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
BLOC1S2Q6QNY1 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
BLOC1S2Q6QNY1 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
BLOC1S2Q6QNY1 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
BLOC1S2Q6QNY1 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
BLOC1S2Q6QNY1 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
BLOC1S2Q6QNY1 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
BLOC1S2Q6QNY1 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
BLOC1S2Q6QNY1 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
BLOC1S2Q6QNY1 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
BLOC1S2Q6QNY1 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
BLOC1S2Q6QNY1 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
BLOC1S2Q6QNY1 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
BLOC1S2Q6QNY1 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
BLOC1S2Q6QNY1 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
BLOC1S2Q6QNY1 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
BLOC1S2Q6QNY1 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
BLOC1S2Q6QNY1 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
BLOC1S2Q6QNY1 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
BLOC1S2Q6QNY1 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
BLOC1S2Q6QNY1 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
BLOC1S2Q6QNY1 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
BLOC1S2Q6QNY1 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
BLOC1S2Q6QNY1 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
BLOC1S2Q6QNY1 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
BLOC1S2Q6QNY1 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
BLOC1S2Q6QNY1 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
BLOC1S2Q6QNY1 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
BLOC1S2Q6QNY1 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
BLOC1S2Q6QNY1 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
BLOC1S2Q6QNY1 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
BLOC1S2Q6QNY1 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
BLOC1S2Q6QNY1 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
BLOC1S2Q6QNY1 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
BLOC1S2Q6QNY1 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
BLOC1S2Q6QNY1 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
BLOC1S2Q6QNY1 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
BLOC1S2Q6QNY1 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
BLOC1S2Q6QNY1 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
BLOC1S2Q6QNY1 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
BLOC1S2Q6QNY1 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
BLOC1S2Q6QNY1 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
BLOC1S2Q6QNY1 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
BLOC1S2Q6QNY1 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
BLOC1S2Q6QNY1 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
BLOC1S2Q6QNY1 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
BLOC1S2Q6QNY1 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
BLOC1S2Q6QNY1 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
BLOC1S2Q6QNY1 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
BLOC1S2Q6QNY1 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
BLOC1S2Q6QNY1 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
BLOC1S2Q6QNY1 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
BLOC1S2Q6QNY1 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
BLOC1S2Q6QNY1 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
BLOC1S2Q6QNY1 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
BLOC1S2Q6QNY1 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
BLOC1S2Q6QNY1 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
BLOC1S2Q6QNY1 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
BLOC1S2Q6QNY1 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
BLOC1S2Q6QNY1 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
BLOC1S2Q6QNY1 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms