Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q795

Putative viral protein-binding protein C1, humanhuman

Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6Q795 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Q6Q795 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Q6Q795 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Q6Q795 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Q6Q795 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Q6Q795 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Q6Q795 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Q6Q795 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Q6Q795 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Q6Q795 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Q6Q795 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Q6Q795 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Q6Q795 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Q6Q795 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Q6Q795 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Q6Q795 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Q6Q795 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Q6Q795 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Q6Q795 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Q6Q795 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Q6Q795 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Q6Q795 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Q6Q795 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Q6Q795 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Q6Q795 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Q6Q795 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Q6Q795 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Q6Q795 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Q6Q795 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Q6Q795 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Q6Q795 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Q6Q795 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Q6Q795 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Q6Q795 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Q6Q795 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Q6Q795 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Q6Q795 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Q6Q795 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Q6Q795 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Q6Q795 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Q6Q795 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Q6Q795 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Q6Q795 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Q6Q795 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Q6Q795 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Q6Q795 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Q6Q795 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Q6Q795 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Q6Q795 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Q6Q795 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Q6Q795 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Q6Q795 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Q6Q795 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Q6Q795 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Q6Q795 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Q6Q795 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Q6Q795 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Q6Q795 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Q6Q795 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Q6Q795 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Q6Q795 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Q6Q795 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Q6Q795 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Q6Q795 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Q6Q795 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Q6Q795 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Q6Q795 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Q6Q795 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Q6Q795 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Q6Q795 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Q6Q795 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Q6Q795 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Q6Q795 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Q6Q795 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Q6Q795 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Q6Q795 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Q6Q795 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Q6Q795 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Q6Q795 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Q6Q795 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Q6Q795 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Q6Q795 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Q6Q795 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Q6Q795 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Q6Q795 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Q6Q795 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Q6Q795 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Q6Q795 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Q6Q795 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Q6Q795 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Q6Q795 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Q6Q795 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Q6Q795 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Q6Q795 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Q6Q795 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Q6Q795 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Q6Q795 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Q6Q795 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Q6Q795 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Q6Q795 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms