Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5Q4

LMOD2, Leiomodin-2, humanhuman

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMOD2Q6P5Q4 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
LMOD2Q6P5Q4 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
LMOD2Q6P5Q4 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
LMOD2Q6P5Q4 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
LMOD2Q6P5Q4 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
LMOD2Q6P5Q4 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
LMOD2Q6P5Q4 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
LMOD2Q6P5Q4 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
LMOD2Q6P5Q4 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
LMOD2Q6P5Q4 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
LMOD2Q6P5Q4 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
LMOD2Q6P5Q4 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
LMOD2Q6P5Q4 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
LMOD2Q6P5Q4 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
LMOD2Q6P5Q4 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
LMOD2Q6P5Q4 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
LMOD2Q6P5Q4 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
LMOD2Q6P5Q4 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
LMOD2Q6P5Q4 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
LMOD2Q6P5Q4 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
LMOD2Q6P5Q4 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
LMOD2Q6P5Q4 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
LMOD2Q6P5Q4 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
LMOD2Q6P5Q4 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
LMOD2Q6P5Q4 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
LMOD2Q6P5Q4 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
LMOD2Q6P5Q4 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
LMOD2Q6P5Q4 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
LMOD2Q6P5Q4 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
LMOD2Q6P5Q4 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
LMOD2Q6P5Q4 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
LMOD2Q6P5Q4 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
LMOD2Q6P5Q4 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
LMOD2Q6P5Q4 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
LMOD2Q6P5Q4 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
LMOD2Q6P5Q4 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
LMOD2Q6P5Q4 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
LMOD2Q6P5Q4 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
LMOD2Q6P5Q4 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
LMOD2Q6P5Q4 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
LMOD2Q6P5Q4 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
LMOD2Q6P5Q4 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
LMOD2Q6P5Q4 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
LMOD2Q6P5Q4 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
LMOD2Q6P5Q4 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
LMOD2Q6P5Q4 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
LMOD2Q6P5Q4 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
LMOD2Q6P5Q4 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
LMOD2Q6P5Q4 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
LMOD2Q6P5Q4 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
LMOD2Q6P5Q4 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
LMOD2Q6P5Q4 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
LMOD2Q6P5Q4 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
LMOD2Q6P5Q4 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
LMOD2Q6P5Q4 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
LMOD2Q6P5Q4 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
LMOD2Q6P5Q4 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
LMOD2Q6P5Q4 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
LMOD2Q6P5Q4 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
LMOD2Q6P5Q4 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
LMOD2Q6P5Q4 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
LMOD2Q6P5Q4 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
LMOD2Q6P5Q4 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
LMOD2Q6P5Q4 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
LMOD2Q6P5Q4 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
LMOD2Q6P5Q4 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
LMOD2Q6P5Q4 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
LMOD2Q6P5Q4 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
LMOD2Q6P5Q4 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
LMOD2Q6P5Q4 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
LMOD2Q6P5Q4 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
LMOD2Q6P5Q4 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
LMOD2Q6P5Q4 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
LMOD2Q6P5Q4 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
LMOD2Q6P5Q4 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
LMOD2Q6P5Q4 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
LMOD2Q6P5Q4 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
LMOD2Q6P5Q4 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
LMOD2Q6P5Q4 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
LMOD2Q6P5Q4 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
LMOD2Q6P5Q4 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
LMOD2Q6P5Q4 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
LMOD2Q6P5Q4 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
LMOD2Q6P5Q4 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
LMOD2Q6P5Q4 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
LMOD2Q6P5Q4 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
LMOD2Q6P5Q4 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
LMOD2Q6P5Q4 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
LMOD2Q6P5Q4 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
LMOD2Q6P5Q4 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
LMOD2Q6P5Q4 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
LMOD2Q6P5Q4 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
LMOD2Q6P5Q4 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
LMOD2Q6P5Q4 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
LMOD2Q6P5Q4 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
LMOD2Q6P5Q4 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
LMOD2Q6P5Q4 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
LMOD2Q6P5Q4 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
LMOD2Q6P5Q4 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
LMOD2Q6P5Q4 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms