Protein–RNA interactions for Protein: Q6P435

Putative uncharacterized SMG1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6P435 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q6P435 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q6P435 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q6P435 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q6P435 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q6P435 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q6P435 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q6P435 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Q6P435 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q6P435 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q6P435 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q6P435 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q6P435 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q6P435 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q6P435 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q6P435 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q6P435 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q6P435 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q6P435 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q6P435 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q6P435 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q6P435 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q6P435 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q6P435 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q6P435 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q6P435 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q6P435 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q6P435 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q6P435 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q6P435 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q6P435 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q6P435 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q6P435 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q6P435 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q6P435 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q6P435 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q6P435 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q6P435 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q6P435 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Q6P435 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q6P435 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q6P435 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q6P435 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q6P435 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q6P435 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q6P435 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q6P435 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q6P435 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q6P435 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Q6P435 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Q6P435 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q6P435 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q6P435 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q6P435 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q6P435 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q6P435 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q6P435 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q6P435 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q6P435 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q6P435 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q6P435 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q6P435 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q6P435 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q6P435 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q6P435 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q6P435 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q6P435 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q6P435 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q6P435 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q6P435 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q6P435 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q6P435 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q6P435 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Q6P435 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q6P435 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q6P435 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q6P435 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q6P435 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q6P435 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q6P435 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q6P435 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q6P435 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q6P435 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q6P435 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q6P435 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q6P435 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q6P435 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q6P435 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q6P435 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q6P435 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q6P435 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q6P435 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q6P435 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q6P435 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q6P435 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q6P435 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q6P435 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q6P435 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q6P435 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q6P435 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.2 ms