Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2S7

TTC41P, Putative tetratricopeptide repeat protein 41, humanhuman

Predictions only

Length 1,318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC41PQ6P2S7 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TTC41PQ6P2S7 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TTC41PQ6P2S7 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TTC41PQ6P2S7 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TTC41PQ6P2S7 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TTC41PQ6P2S7 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TTC41PQ6P2S7 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
TTC41PQ6P2S7 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TTC41PQ6P2S7 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TTC41PQ6P2S7 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TTC41PQ6P2S7 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TTC41PQ6P2S7 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
TTC41PQ6P2S7 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TTC41PQ6P2S7 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TTC41PQ6P2S7 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TTC41PQ6P2S7 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TTC41PQ6P2S7 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TTC41PQ6P2S7 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TTC41PQ6P2S7 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TTC41PQ6P2S7 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TTC41PQ6P2S7 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TTC41PQ6P2S7 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TTC41PQ6P2S7 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TTC41PQ6P2S7 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TTC41PQ6P2S7 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TTC41PQ6P2S7 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TTC41PQ6P2S7 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TTC41PQ6P2S7 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TTC41PQ6P2S7 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TTC41PQ6P2S7 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TTC41PQ6P2S7 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TTC41PQ6P2S7 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TTC41PQ6P2S7 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TTC41PQ6P2S7 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
TTC41PQ6P2S7 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TTC41PQ6P2S7 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TTC41PQ6P2S7 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TTC41PQ6P2S7 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TTC41PQ6P2S7 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TTC41PQ6P2S7 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.47
TTC41PQ6P2S7 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TTC41PQ6P2S7 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TTC41PQ6P2S7 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TTC41PQ6P2S7 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TTC41PQ6P2S7 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TTC41PQ6P2S7 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TTC41PQ6P2S7 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TTC41PQ6P2S7 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
TTC41PQ6P2S7 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TTC41PQ6P2S7 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TTC41PQ6P2S7 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TTC41PQ6P2S7 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TTC41PQ6P2S7 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TTC41PQ6P2S7 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TTC41PQ6P2S7 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TTC41PQ6P2S7 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TTC41PQ6P2S7 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TTC41PQ6P2S7 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TTC41PQ6P2S7 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TTC41PQ6P2S7 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
TTC41PQ6P2S7 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TTC41PQ6P2S7 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TTC41PQ6P2S7 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TTC41PQ6P2S7 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TTC41PQ6P2S7 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TTC41PQ6P2S7 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TTC41PQ6P2S7 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TTC41PQ6P2S7 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TTC41PQ6P2S7 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TTC41PQ6P2S7 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TTC41PQ6P2S7 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TTC41PQ6P2S7 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TTC41PQ6P2S7 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TTC41PQ6P2S7 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
TTC41PQ6P2S7 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TTC41PQ6P2S7 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TTC41PQ6P2S7 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
TTC41PQ6P2S7 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TTC41PQ6P2S7 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TTC41PQ6P2S7 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TTC41PQ6P2S7 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TTC41PQ6P2S7 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TTC41PQ6P2S7 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TTC41PQ6P2S7 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TTC41PQ6P2S7 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TTC41PQ6P2S7 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TTC41PQ6P2S7 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TTC41PQ6P2S7 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TTC41PQ6P2S7 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TTC41PQ6P2S7 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TTC41PQ6P2S7 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TTC41PQ6P2S7 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TTC41PQ6P2S7 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TTC41PQ6P2S7 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TTC41PQ6P2S7 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TTC41PQ6P2S7 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TTC41PQ6P2S7 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TTC41PQ6P2S7 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TTC41PQ6P2S7 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TTC41PQ6P2S7 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms