Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZY7

CDC42EP5, Cdc42 effector protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP5Q6NZY7 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CDC42EP5Q6NZY7 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CDC42EP5Q6NZY7 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CDC42EP5Q6NZY7 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CDC42EP5Q6NZY7 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CDC42EP5Q6NZY7 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CDC42EP5Q6NZY7 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CDC42EP5Q6NZY7 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CDC42EP5Q6NZY7 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CDC42EP5Q6NZY7 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CDC42EP5Q6NZY7 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CDC42EP5Q6NZY7 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CDC42EP5Q6NZY7 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CDC42EP5Q6NZY7 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CDC42EP5Q6NZY7 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CDC42EP5Q6NZY7 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CDC42EP5Q6NZY7 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CDC42EP5Q6NZY7 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CDC42EP5Q6NZY7 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CDC42EP5Q6NZY7 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CDC42EP5Q6NZY7 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CDC42EP5Q6NZY7 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
CDC42EP5Q6NZY7 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CDC42EP5Q6NZY7 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CDC42EP5Q6NZY7 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CDC42EP5Q6NZY7 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CDC42EP5Q6NZY7 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
CDC42EP5Q6NZY7 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CDC42EP5Q6NZY7 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CDC42EP5Q6NZY7 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CDC42EP5Q6NZY7 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CDC42EP5Q6NZY7 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CDC42EP5Q6NZY7 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CDC42EP5Q6NZY7 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CDC42EP5Q6NZY7 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CDC42EP5Q6NZY7 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CDC42EP5Q6NZY7 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
CDC42EP5Q6NZY7 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CDC42EP5Q6NZY7 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CDC42EP5Q6NZY7 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CDC42EP5Q6NZY7 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CDC42EP5Q6NZY7 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CDC42EP5Q6NZY7 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CDC42EP5Q6NZY7 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CDC42EP5Q6NZY7 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CDC42EP5Q6NZY7 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CDC42EP5Q6NZY7 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CDC42EP5Q6NZY7 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CDC42EP5Q6NZY7 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CDC42EP5Q6NZY7 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CDC42EP5Q6NZY7 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CDC42EP5Q6NZY7 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CDC42EP5Q6NZY7 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CDC42EP5Q6NZY7 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CDC42EP5Q6NZY7 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CDC42EP5Q6NZY7 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CDC42EP5Q6NZY7 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CDC42EP5Q6NZY7 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CDC42EP5Q6NZY7 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CDC42EP5Q6NZY7 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CDC42EP5Q6NZY7 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CDC42EP5Q6NZY7 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CDC42EP5Q6NZY7 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CDC42EP5Q6NZY7 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CDC42EP5Q6NZY7 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CDC42EP5Q6NZY7 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CDC42EP5Q6NZY7 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CDC42EP5Q6NZY7 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CDC42EP5Q6NZY7 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CDC42EP5Q6NZY7 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CDC42EP5Q6NZY7 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CDC42EP5Q6NZY7 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CDC42EP5Q6NZY7 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CDC42EP5Q6NZY7 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CDC42EP5Q6NZY7 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CDC42EP5Q6NZY7 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CDC42EP5Q6NZY7 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CDC42EP5Q6NZY7 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CDC42EP5Q6NZY7 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CDC42EP5Q6NZY7 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CDC42EP5Q6NZY7 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CDC42EP5Q6NZY7 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CDC42EP5Q6NZY7 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CDC42EP5Q6NZY7 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CDC42EP5Q6NZY7 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CDC42EP5Q6NZY7 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CDC42EP5Q6NZY7 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CDC42EP5Q6NZY7 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CDC42EP5Q6NZY7 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CDC42EP5Q6NZY7 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CDC42EP5Q6NZY7 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CDC42EP5Q6NZY7 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CDC42EP5Q6NZY7 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CDC42EP5Q6NZY7 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CDC42EP5Q6NZY7 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CDC42EP5Q6NZY7 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CDC42EP5Q6NZY7 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CDC42EP5Q6NZY7 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CDC42EP5Q6NZY7 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CDC42EP5Q6NZY7 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92 ms