Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVH7

SWSAP1, ATPase SWSAP1, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SWSAP1Q6NVH7 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SWSAP1Q6NVH7 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SWSAP1Q6NVH7 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SWSAP1Q6NVH7 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SWSAP1Q6NVH7 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SWSAP1Q6NVH7 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SWSAP1Q6NVH7 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SWSAP1Q6NVH7 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SWSAP1Q6NVH7 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SWSAP1Q6NVH7 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SWSAP1Q6NVH7 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SWSAP1Q6NVH7 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SWSAP1Q6NVH7 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SWSAP1Q6NVH7 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SWSAP1Q6NVH7 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SWSAP1Q6NVH7 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SWSAP1Q6NVH7 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SWSAP1Q6NVH7 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SWSAP1Q6NVH7 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SWSAP1Q6NVH7 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SWSAP1Q6NVH7 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SWSAP1Q6NVH7 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SWSAP1Q6NVH7 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SWSAP1Q6NVH7 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SWSAP1Q6NVH7 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SWSAP1Q6NVH7 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SWSAP1Q6NVH7 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SWSAP1Q6NVH7 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SWSAP1Q6NVH7 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SWSAP1Q6NVH7 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SWSAP1Q6NVH7 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SWSAP1Q6NVH7 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SWSAP1Q6NVH7 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SWSAP1Q6NVH7 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SWSAP1Q6NVH7 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SWSAP1Q6NVH7 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SWSAP1Q6NVH7 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SWSAP1Q6NVH7 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SWSAP1Q6NVH7 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SWSAP1Q6NVH7 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SWSAP1Q6NVH7 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SWSAP1Q6NVH7 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SWSAP1Q6NVH7 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SWSAP1Q6NVH7 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SWSAP1Q6NVH7 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SWSAP1Q6NVH7 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SWSAP1Q6NVH7 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SWSAP1Q6NVH7 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SWSAP1Q6NVH7 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SWSAP1Q6NVH7 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SWSAP1Q6NVH7 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SWSAP1Q6NVH7 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SWSAP1Q6NVH7 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SWSAP1Q6NVH7 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SWSAP1Q6NVH7 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SWSAP1Q6NVH7 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SWSAP1Q6NVH7 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SWSAP1Q6NVH7 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SWSAP1Q6NVH7 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SWSAP1Q6NVH7 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SWSAP1Q6NVH7 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SWSAP1Q6NVH7 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SWSAP1Q6NVH7 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SWSAP1Q6NVH7 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SWSAP1Q6NVH7 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SWSAP1Q6NVH7 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SWSAP1Q6NVH7 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SWSAP1Q6NVH7 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SWSAP1Q6NVH7 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SWSAP1Q6NVH7 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SWSAP1Q6NVH7 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SWSAP1Q6NVH7 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SWSAP1Q6NVH7 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SWSAP1Q6NVH7 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SWSAP1Q6NVH7 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SWSAP1Q6NVH7 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SWSAP1Q6NVH7 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SWSAP1Q6NVH7 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SWSAP1Q6NVH7 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
SWSAP1Q6NVH7 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
SWSAP1Q6NVH7 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.15
SWSAP1Q6NVH7 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
SWSAP1Q6NVH7 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
SWSAP1Q6NVH7 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SWSAP1Q6NVH7 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SWSAP1Q6NVH7 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SWSAP1Q6NVH7 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SWSAP1Q6NVH7 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SWSAP1Q6NVH7 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SWSAP1Q6NVH7 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SWSAP1Q6NVH7 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SWSAP1Q6NVH7 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SWSAP1Q6NVH7 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SWSAP1Q6NVH7 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SWSAP1Q6NVH7 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SWSAP1Q6NVH7 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SWSAP1Q6NVH7 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SWSAP1Q6NVH7 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SWSAP1Q6NVH7 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SWSAP1Q6NVH7 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms