Protein–RNA interactions for Protein: Q6JBY9

RCSD1, CapZ-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCSD1Q6JBY9 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RCSD1Q6JBY9 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RCSD1Q6JBY9 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RCSD1Q6JBY9 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RCSD1Q6JBY9 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RCSD1Q6JBY9 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RCSD1Q6JBY9 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RCSD1Q6JBY9 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RCSD1Q6JBY9 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RCSD1Q6JBY9 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RCSD1Q6JBY9 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RCSD1Q6JBY9 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RCSD1Q6JBY9 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RCSD1Q6JBY9 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RCSD1Q6JBY9 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RCSD1Q6JBY9 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RCSD1Q6JBY9 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RCSD1Q6JBY9 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RCSD1Q6JBY9 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RCSD1Q6JBY9 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RCSD1Q6JBY9 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
RCSD1Q6JBY9 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RCSD1Q6JBY9 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RCSD1Q6JBY9 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RCSD1Q6JBY9 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RCSD1Q6JBY9 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RCSD1Q6JBY9 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RCSD1Q6JBY9 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RCSD1Q6JBY9 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RCSD1Q6JBY9 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RCSD1Q6JBY9 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RCSD1Q6JBY9 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RCSD1Q6JBY9 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RCSD1Q6JBY9 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RCSD1Q6JBY9 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RCSD1Q6JBY9 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RCSD1Q6JBY9 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RCSD1Q6JBY9 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RCSD1Q6JBY9 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RCSD1Q6JBY9 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RCSD1Q6JBY9 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RCSD1Q6JBY9 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RCSD1Q6JBY9 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RCSD1Q6JBY9 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RCSD1Q6JBY9 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RCSD1Q6JBY9 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RCSD1Q6JBY9 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RCSD1Q6JBY9 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RCSD1Q6JBY9 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RCSD1Q6JBY9 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RCSD1Q6JBY9 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RCSD1Q6JBY9 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RCSD1Q6JBY9 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RCSD1Q6JBY9 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RCSD1Q6JBY9 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RCSD1Q6JBY9 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RCSD1Q6JBY9 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RCSD1Q6JBY9 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RCSD1Q6JBY9 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RCSD1Q6JBY9 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RCSD1Q6JBY9 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RCSD1Q6JBY9 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RCSD1Q6JBY9 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RCSD1Q6JBY9 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RCSD1Q6JBY9 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RCSD1Q6JBY9 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RCSD1Q6JBY9 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RCSD1Q6JBY9 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RCSD1Q6JBY9 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RCSD1Q6JBY9 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RCSD1Q6JBY9 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RCSD1Q6JBY9 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RCSD1Q6JBY9 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
RCSD1Q6JBY9 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RCSD1Q6JBY9 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RCSD1Q6JBY9 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RCSD1Q6JBY9 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RCSD1Q6JBY9 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RCSD1Q6JBY9 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
RCSD1Q6JBY9 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RCSD1Q6JBY9 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RCSD1Q6JBY9 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RCSD1Q6JBY9 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RCSD1Q6JBY9 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RCSD1Q6JBY9 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RCSD1Q6JBY9 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RCSD1Q6JBY9 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RCSD1Q6JBY9 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RCSD1Q6JBY9 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
RCSD1Q6JBY9 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RCSD1Q6JBY9 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RCSD1Q6JBY9 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RCSD1Q6JBY9 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RCSD1Q6JBY9 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RCSD1Q6JBY9 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RCSD1Q6JBY9 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
RCSD1Q6JBY9 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RCSD1Q6JBY9 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RCSD1Q6JBY9 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RCSD1Q6JBY9 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms