Protein–RNA interactions for Protein: Q5VST9

OBSCN, Obscurin, humanhuman

Predictions only

Length 7,968 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OBSCNQ5VST9 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
OBSCNQ5VST9 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
OBSCNQ5VST9 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
OBSCNQ5VST9 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
OBSCNQ5VST9 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
OBSCNQ5VST9 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
OBSCNQ5VST9 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
OBSCNQ5VST9 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
OBSCNQ5VST9 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
OBSCNQ5VST9 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
OBSCNQ5VST9 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
OBSCNQ5VST9 NUB1-212ENST00000568733 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
OBSCNQ5VST9 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
OBSCNQ5VST9 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
OBSCNQ5VST9 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
OBSCNQ5VST9 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
OBSCNQ5VST9 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
OBSCNQ5VST9 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
OBSCNQ5VST9 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
OBSCNQ5VST9 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
OBSCNQ5VST9 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
OBSCNQ5VST9 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
OBSCNQ5VST9 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
OBSCNQ5VST9 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
OBSCNQ5VST9 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
OBSCNQ5VST9 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
OBSCNQ5VST9 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
OBSCNQ5VST9 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
OBSCNQ5VST9 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
OBSCNQ5VST9 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
OBSCNQ5VST9 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
OBSCNQ5VST9 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
OBSCNQ5VST9 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
OBSCNQ5VST9 ATP13A2-203ENST00000452699 3981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
OBSCNQ5VST9 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
OBSCNQ5VST9 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
OBSCNQ5VST9 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
OBSCNQ5VST9 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
OBSCNQ5VST9 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
OBSCNQ5VST9 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
OBSCNQ5VST9 ABCA17P-202ENST00000469908 4188 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
OBSCNQ5VST9 PPP6R2-202ENST00000359139 4035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
OBSCNQ5VST9 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
OBSCNQ5VST9 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
OBSCNQ5VST9 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
OBSCNQ5VST9 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
OBSCNQ5VST9 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
OBSCNQ5VST9 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
OBSCNQ5VST9 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
OBSCNQ5VST9 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
OBSCNQ5VST9 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
OBSCNQ5VST9 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
OBSCNQ5VST9 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
OBSCNQ5VST9 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
OBSCNQ5VST9 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
OBSCNQ5VST9 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
OBSCNQ5VST9 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC5.55□□□□□ -1.52
OBSCNQ5VST9 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
OBSCNQ5VST9 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
OBSCNQ5VST9 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC5.55□□□□□ -1.52
OBSCNQ5VST9 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
OBSCNQ5VST9 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
OBSCNQ5VST9 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
OBSCNQ5VST9 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
OBSCNQ5VST9 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
OBSCNQ5VST9 RGS22-201ENST00000360863 4296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
OBSCNQ5VST9 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
OBSCNQ5VST9 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
OBSCNQ5VST9 SLC6A10P-201ENST00000330048 3846 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
OBSCNQ5VST9 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
OBSCNQ5VST9 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
OBSCNQ5VST9 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
OBSCNQ5VST9 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
OBSCNQ5VST9 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
OBSCNQ5VST9 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
OBSCNQ5VST9 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
OBSCNQ5VST9 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
OBSCNQ5VST9 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
OBSCNQ5VST9 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
OBSCNQ5VST9 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
OBSCNQ5VST9 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
OBSCNQ5VST9 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
OBSCNQ5VST9 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
OBSCNQ5VST9 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
OBSCNQ5VST9 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
OBSCNQ5VST9 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
OBSCNQ5VST9 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
OBSCNQ5VST9 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
OBSCNQ5VST9 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
OBSCNQ5VST9 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
OBSCNQ5VST9 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
OBSCNQ5VST9 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
OBSCNQ5VST9 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
OBSCNQ5VST9 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
OBSCNQ5VST9 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
OBSCNQ5VST9 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
OBSCNQ5VST9 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
OBSCNQ5VST9 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
OBSCNQ5VST9 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
OBSCNQ5VST9 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms