Protein–RNA interactions for Protein: Q5VSD8

Putative uncharacterized protein LOC401522, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q5VSD8 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Q5VSD8 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Q5VSD8 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Q5VSD8 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Q5VSD8 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Q5VSD8 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Q5VSD8 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Q5VSD8 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Q5VSD8 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Q5VSD8 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Q5VSD8 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Q5VSD8 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Q5VSD8 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Q5VSD8 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Q5VSD8 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Q5VSD8 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Q5VSD8 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Q5VSD8 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Q5VSD8 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Q5VSD8 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Q5VSD8 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Q5VSD8 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Q5VSD8 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Q5VSD8 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Q5VSD8 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Q5VSD8 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Q5VSD8 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Q5VSD8 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Q5VSD8 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Q5VSD8 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Q5VSD8 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Q5VSD8 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Q5VSD8 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Q5VSD8 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Q5VSD8 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Q5VSD8 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Q5VSD8 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Q5VSD8 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Q5VSD8 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Q5VSD8 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Q5VSD8 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Q5VSD8 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Q5VSD8 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Q5VSD8 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Q5VSD8 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Q5VSD8 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Q5VSD8 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Q5VSD8 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Q5VSD8 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Q5VSD8 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Q5VSD8 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Q5VSD8 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Q5VSD8 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Q5VSD8 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Q5VSD8 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Q5VSD8 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Q5VSD8 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Q5VSD8 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Q5VSD8 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Q5VSD8 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Q5VSD8 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Q5VSD8 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Q5VSD8 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Q5VSD8 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Q5VSD8 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Q5VSD8 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Q5VSD8 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Q5VSD8 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Q5VSD8 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Q5VSD8 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Q5VSD8 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Q5VSD8 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Q5VSD8 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Q5VSD8 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Q5VSD8 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Q5VSD8 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Q5VSD8 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Q5VSD8 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Q5VSD8 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Q5VSD8 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Q5VSD8 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Q5VSD8 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Q5VSD8 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Q5VSD8 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Q5VSD8 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Q5VSD8 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Q5VSD8 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Q5VSD8 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Q5VSD8 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Q5VSD8 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Q5VSD8 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Q5VSD8 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Q5VSD8 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Q5VSD8 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Q5VSD8 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Q5VSD8 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Q5VSD8 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Q5VSD8 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Q5VSD8 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Q5VSD8 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100 ms