Protein–RNA interactions for Protein: Q5TF21

SOGA3, Protein SOGA3, humanhuman

Predictions only

Length 947 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOGA3Q5TF21 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SOGA3Q5TF21 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SOGA3Q5TF21 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SOGA3Q5TF21 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SOGA3Q5TF21 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SOGA3Q5TF21 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SOGA3Q5TF21 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SOGA3Q5TF21 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SOGA3Q5TF21 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SOGA3Q5TF21 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SOGA3Q5TF21 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SOGA3Q5TF21 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SOGA3Q5TF21 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
SOGA3Q5TF21 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
SOGA3Q5TF21 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SOGA3Q5TF21 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
SOGA3Q5TF21 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SOGA3Q5TF21 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SOGA3Q5TF21 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SOGA3Q5TF21 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SOGA3Q5TF21 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SOGA3Q5TF21 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SOGA3Q5TF21 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SOGA3Q5TF21 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SOGA3Q5TF21 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SOGA3Q5TF21 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SOGA3Q5TF21 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
SOGA3Q5TF21 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SOGA3Q5TF21 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SOGA3Q5TF21 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SOGA3Q5TF21 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SOGA3Q5TF21 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SOGA3Q5TF21 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SOGA3Q5TF21 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SOGA3Q5TF21 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
SOGA3Q5TF21 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SOGA3Q5TF21 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SOGA3Q5TF21 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
SOGA3Q5TF21 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SOGA3Q5TF21 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SOGA3Q5TF21 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SOGA3Q5TF21 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SOGA3Q5TF21 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SOGA3Q5TF21 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SOGA3Q5TF21 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SOGA3Q5TF21 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SOGA3Q5TF21 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SOGA3Q5TF21 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SOGA3Q5TF21 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SOGA3Q5TF21 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SOGA3Q5TF21 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SOGA3Q5TF21 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SOGA3Q5TF21 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SOGA3Q5TF21 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SOGA3Q5TF21 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SOGA3Q5TF21 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SOGA3Q5TF21 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SOGA3Q5TF21 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SOGA3Q5TF21 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SOGA3Q5TF21 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
SOGA3Q5TF21 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SOGA3Q5TF21 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SOGA3Q5TF21 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SOGA3Q5TF21 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SOGA3Q5TF21 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SOGA3Q5TF21 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SOGA3Q5TF21 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SOGA3Q5TF21 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SOGA3Q5TF21 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SOGA3Q5TF21 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SOGA3Q5TF21 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SOGA3Q5TF21 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SOGA3Q5TF21 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SOGA3Q5TF21 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SOGA3Q5TF21 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SOGA3Q5TF21 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SOGA3Q5TF21 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SOGA3Q5TF21 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SOGA3Q5TF21 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SOGA3Q5TF21 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SOGA3Q5TF21 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SOGA3Q5TF21 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SOGA3Q5TF21 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SOGA3Q5TF21 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SOGA3Q5TF21 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SOGA3Q5TF21 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SOGA3Q5TF21 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SOGA3Q5TF21 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SOGA3Q5TF21 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SOGA3Q5TF21 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SOGA3Q5TF21 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SOGA3Q5TF21 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SOGA3Q5TF21 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SOGA3Q5TF21 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
SOGA3Q5TF21 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SOGA3Q5TF21 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SOGA3Q5TF21 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SOGA3Q5TF21 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
SOGA3Q5TF21 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SOGA3Q5TF21 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms