Protein–RNA interactions for Protein: Q5JV73

FRMPD3, FERM and PDZ domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,810 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMPD3Q5JV73 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FRMPD3Q5JV73 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FRMPD3Q5JV73 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FRMPD3Q5JV73 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FRMPD3Q5JV73 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FRMPD3Q5JV73 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FRMPD3Q5JV73 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FRMPD3Q5JV73 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FRMPD3Q5JV73 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FRMPD3Q5JV73 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FRMPD3Q5JV73 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FRMPD3Q5JV73 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FRMPD3Q5JV73 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FRMPD3Q5JV73 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FRMPD3Q5JV73 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FRMPD3Q5JV73 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
FRMPD3Q5JV73 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FRMPD3Q5JV73 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FRMPD3Q5JV73 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FRMPD3Q5JV73 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FRMPD3Q5JV73 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FRMPD3Q5JV73 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FRMPD3Q5JV73 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FRMPD3Q5JV73 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FRMPD3Q5JV73 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FRMPD3Q5JV73 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FRMPD3Q5JV73 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FRMPD3Q5JV73 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FRMPD3Q5JV73 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FRMPD3Q5JV73 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FRMPD3Q5JV73 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FRMPD3Q5JV73 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
FRMPD3Q5JV73 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FRMPD3Q5JV73 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FRMPD3Q5JV73 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FRMPD3Q5JV73 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FRMPD3Q5JV73 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FRMPD3Q5JV73 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FRMPD3Q5JV73 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FRMPD3Q5JV73 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FRMPD3Q5JV73 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
FRMPD3Q5JV73 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FRMPD3Q5JV73 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
FRMPD3Q5JV73 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FRMPD3Q5JV73 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FRMPD3Q5JV73 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FRMPD3Q5JV73 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FRMPD3Q5JV73 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FRMPD3Q5JV73 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FRMPD3Q5JV73 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FRMPD3Q5JV73 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
FRMPD3Q5JV73 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FRMPD3Q5JV73 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FRMPD3Q5JV73 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FRMPD3Q5JV73 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FRMPD3Q5JV73 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
FRMPD3Q5JV73 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FRMPD3Q5JV73 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FRMPD3Q5JV73 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FRMPD3Q5JV73 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FRMPD3Q5JV73 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FRMPD3Q5JV73 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
FRMPD3Q5JV73 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FRMPD3Q5JV73 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FRMPD3Q5JV73 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FRMPD3Q5JV73 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FRMPD3Q5JV73 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
FRMPD3Q5JV73 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
FRMPD3Q5JV73 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FRMPD3Q5JV73 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
FRMPD3Q5JV73 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
FRMPD3Q5JV73 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FRMPD3Q5JV73 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
FRMPD3Q5JV73 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
FRMPD3Q5JV73 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
FRMPD3Q5JV73 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
FRMPD3Q5JV73 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FRMPD3Q5JV73 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FRMPD3Q5JV73 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FRMPD3Q5JV73 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FRMPD3Q5JV73 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FRMPD3Q5JV73 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FRMPD3Q5JV73 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FRMPD3Q5JV73 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FRMPD3Q5JV73 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FRMPD3Q5JV73 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FRMPD3Q5JV73 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FRMPD3Q5JV73 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FRMPD3Q5JV73 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FRMPD3Q5JV73 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
FRMPD3Q5JV73 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FRMPD3Q5JV73 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FRMPD3Q5JV73 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FRMPD3Q5JV73 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FRMPD3Q5JV73 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FRMPD3Q5JV73 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FRMPD3Q5JV73 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FRMPD3Q5JV73 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FRMPD3Q5JV73 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FRMPD3Q5JV73 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms