Protein–RNA interactions for Protein: Q5JQC4

CT47A1, Cancer/testis antigen 47A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CT47A1Q5JQC4 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CT47A1Q5JQC4 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CT47A1Q5JQC4 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CT47A1Q5JQC4 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CT47A1Q5JQC4 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CT47A1Q5JQC4 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CT47A1Q5JQC4 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CT47A1Q5JQC4 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CT47A1Q5JQC4 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CT47A1Q5JQC4 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CT47A1Q5JQC4 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CT47A1Q5JQC4 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CT47A1Q5JQC4 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CT47A1Q5JQC4 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CT47A1Q5JQC4 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CT47A1Q5JQC4 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CT47A1Q5JQC4 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CT47A1Q5JQC4 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CT47A1Q5JQC4 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CT47A1Q5JQC4 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CT47A1Q5JQC4 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CT47A1Q5JQC4 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CT47A1Q5JQC4 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CT47A1Q5JQC4 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CT47A1Q5JQC4 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CT47A1Q5JQC4 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CT47A1Q5JQC4 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CT47A1Q5JQC4 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CT47A1Q5JQC4 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CT47A1Q5JQC4 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CT47A1Q5JQC4 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CT47A1Q5JQC4 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CT47A1Q5JQC4 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CT47A1Q5JQC4 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CT47A1Q5JQC4 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CT47A1Q5JQC4 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CT47A1Q5JQC4 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CT47A1Q5JQC4 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CT47A1Q5JQC4 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CT47A1Q5JQC4 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CT47A1Q5JQC4 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CT47A1Q5JQC4 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CT47A1Q5JQC4 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CT47A1Q5JQC4 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CT47A1Q5JQC4 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CT47A1Q5JQC4 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CT47A1Q5JQC4 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CT47A1Q5JQC4 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CT47A1Q5JQC4 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CT47A1Q5JQC4 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CT47A1Q5JQC4 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CT47A1Q5JQC4 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CT47A1Q5JQC4 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CT47A1Q5JQC4 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CT47A1Q5JQC4 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CT47A1Q5JQC4 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CT47A1Q5JQC4 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CT47A1Q5JQC4 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CT47A1Q5JQC4 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CT47A1Q5JQC4 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CT47A1Q5JQC4 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CT47A1Q5JQC4 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CT47A1Q5JQC4 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CT47A1Q5JQC4 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CT47A1Q5JQC4 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CT47A1Q5JQC4 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CT47A1Q5JQC4 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CT47A1Q5JQC4 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CT47A1Q5JQC4 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CT47A1Q5JQC4 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CT47A1Q5JQC4 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CT47A1Q5JQC4 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CT47A1Q5JQC4 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CT47A1Q5JQC4 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CT47A1Q5JQC4 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CT47A1Q5JQC4 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CT47A1Q5JQC4 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CT47A1Q5JQC4 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CT47A1Q5JQC4 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CT47A1Q5JQC4 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CT47A1Q5JQC4 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CT47A1Q5JQC4 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CT47A1Q5JQC4 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CT47A1Q5JQC4 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CT47A1Q5JQC4 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
CT47A1Q5JQC4 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CT47A1Q5JQC4 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
CT47A1Q5JQC4 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CT47A1Q5JQC4 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CT47A1Q5JQC4 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CT47A1Q5JQC4 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CT47A1Q5JQC4 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CT47A1Q5JQC4 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CT47A1Q5JQC4 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CT47A1Q5JQC4 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CT47A1Q5JQC4 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CT47A1Q5JQC4 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CT47A1Q5JQC4 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CT47A1Q5JQC4 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CT47A1Q5JQC4 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms