Protein–RNA interactions for Protein: Q5GH77

XKR3, XK-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XKR3Q5GH77 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
XKR3Q5GH77 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
XKR3Q5GH77 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
XKR3Q5GH77 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
XKR3Q5GH77 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
XKR3Q5GH77 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
XKR3Q5GH77 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
XKR3Q5GH77 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
XKR3Q5GH77 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
XKR3Q5GH77 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
XKR3Q5GH77 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
XKR3Q5GH77 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
XKR3Q5GH77 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
XKR3Q5GH77 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
XKR3Q5GH77 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
XKR3Q5GH77 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
XKR3Q5GH77 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
XKR3Q5GH77 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
XKR3Q5GH77 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
XKR3Q5GH77 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
XKR3Q5GH77 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
XKR3Q5GH77 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
XKR3Q5GH77 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
XKR3Q5GH77 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
XKR3Q5GH77 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
XKR3Q5GH77 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
XKR3Q5GH77 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
XKR3Q5GH77 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
XKR3Q5GH77 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
XKR3Q5GH77 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
XKR3Q5GH77 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
XKR3Q5GH77 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
XKR3Q5GH77 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
XKR3Q5GH77 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
XKR3Q5GH77 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
XKR3Q5GH77 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
XKR3Q5GH77 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
XKR3Q5GH77 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
XKR3Q5GH77 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
XKR3Q5GH77 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
XKR3Q5GH77 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
XKR3Q5GH77 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
XKR3Q5GH77 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
XKR3Q5GH77 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
XKR3Q5GH77 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
XKR3Q5GH77 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
XKR3Q5GH77 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
XKR3Q5GH77 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
XKR3Q5GH77 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
XKR3Q5GH77 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
XKR3Q5GH77 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
XKR3Q5GH77 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
XKR3Q5GH77 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
XKR3Q5GH77 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
XKR3Q5GH77 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
XKR3Q5GH77 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
XKR3Q5GH77 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
XKR3Q5GH77 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
XKR3Q5GH77 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
XKR3Q5GH77 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
XKR3Q5GH77 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
XKR3Q5GH77 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
XKR3Q5GH77 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
XKR3Q5GH77 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
XKR3Q5GH77 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
XKR3Q5GH77 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
XKR3Q5GH77 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
XKR3Q5GH77 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
XKR3Q5GH77 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
XKR3Q5GH77 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
XKR3Q5GH77 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
XKR3Q5GH77 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
XKR3Q5GH77 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
XKR3Q5GH77 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
XKR3Q5GH77 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
XKR3Q5GH77 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
XKR3Q5GH77 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
XKR3Q5GH77 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
XKR3Q5GH77 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
XKR3Q5GH77 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
XKR3Q5GH77 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
XKR3Q5GH77 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
XKR3Q5GH77 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
XKR3Q5GH77 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
XKR3Q5GH77 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
XKR3Q5GH77 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
XKR3Q5GH77 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
XKR3Q5GH77 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
XKR3Q5GH77 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
XKR3Q5GH77 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
XKR3Q5GH77 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
XKR3Q5GH77 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
XKR3Q5GH77 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
XKR3Q5GH77 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
XKR3Q5GH77 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
XKR3Q5GH77 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
XKR3Q5GH77 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
XKR3Q5GH77 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
XKR3Q5GH77 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
XKR3Q5GH77 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms