Protein–RNA interactions for Protein: Q53GT1

KLHL22, Kelch-like protein 22, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL22Q53GT1 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
KLHL22Q53GT1 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
KLHL22Q53GT1 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
KLHL22Q53GT1 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
KLHL22Q53GT1 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
KLHL22Q53GT1 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
KLHL22Q53GT1 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
KLHL22Q53GT1 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
KLHL22Q53GT1 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
KLHL22Q53GT1 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
KLHL22Q53GT1 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
KLHL22Q53GT1 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
KLHL22Q53GT1 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KLHL22Q53GT1 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KLHL22Q53GT1 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
KLHL22Q53GT1 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KLHL22Q53GT1 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
KLHL22Q53GT1 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
KLHL22Q53GT1 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KLHL22Q53GT1 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KLHL22Q53GT1 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
KLHL22Q53GT1 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KLHL22Q53GT1 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
KLHL22Q53GT1 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
KLHL22Q53GT1 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
KLHL22Q53GT1 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KLHL22Q53GT1 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KLHL22Q53GT1 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
KLHL22Q53GT1 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KLHL22Q53GT1 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KLHL22Q53GT1 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KLHL22Q53GT1 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KLHL22Q53GT1 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
KLHL22Q53GT1 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KLHL22Q53GT1 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
KLHL22Q53GT1 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
KLHL22Q53GT1 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
KLHL22Q53GT1 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
KLHL22Q53GT1 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
KLHL22Q53GT1 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
KLHL22Q53GT1 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
KLHL22Q53GT1 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
KLHL22Q53GT1 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
KLHL22Q53GT1 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
KLHL22Q53GT1 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
KLHL22Q53GT1 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
KLHL22Q53GT1 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
KLHL22Q53GT1 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
KLHL22Q53GT1 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
KLHL22Q53GT1 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
KLHL22Q53GT1 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
KLHL22Q53GT1 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
KLHL22Q53GT1 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
KLHL22Q53GT1 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
KLHL22Q53GT1 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
KLHL22Q53GT1 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
KLHL22Q53GT1 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
KLHL22Q53GT1 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
KLHL22Q53GT1 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
KLHL22Q53GT1 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
KLHL22Q53GT1 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
KLHL22Q53GT1 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KLHL22Q53GT1 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KLHL22Q53GT1 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
KLHL22Q53GT1 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
KLHL22Q53GT1 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KLHL22Q53GT1 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
KLHL22Q53GT1 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KLHL22Q53GT1 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
KLHL22Q53GT1 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KLHL22Q53GT1 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KLHL22Q53GT1 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
KLHL22Q53GT1 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KLHL22Q53GT1 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KLHL22Q53GT1 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
KLHL22Q53GT1 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
KLHL22Q53GT1 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
KLHL22Q53GT1 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KLHL22Q53GT1 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
KLHL22Q53GT1 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
KLHL22Q53GT1 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
KLHL22Q53GT1 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
KLHL22Q53GT1 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
KLHL22Q53GT1 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
KLHL22Q53GT1 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KLHL22Q53GT1 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
KLHL22Q53GT1 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
KLHL22Q53GT1 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
KLHL22Q53GT1 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
KLHL22Q53GT1 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KLHL22Q53GT1 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KLHL22Q53GT1 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
KLHL22Q53GT1 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KLHL22Q53GT1 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KLHL22Q53GT1 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
KLHL22Q53GT1 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
KLHL22Q53GT1 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
KLHL22Q53GT1 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
KLHL22Q53GT1 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
KLHL22Q53GT1 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms