Protein–RNA interactions for Protein: Q504Q3

PAN2, PAN2-PAN3 deadenylation complex catalytic subunit PAN2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAN2Q504Q3 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PAN2Q504Q3 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PAN2Q504Q3 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PAN2Q504Q3 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PAN2Q504Q3 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PAN2Q504Q3 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PAN2Q504Q3 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PAN2Q504Q3 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PAN2Q504Q3 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PAN2Q504Q3 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PAN2Q504Q3 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PAN2Q504Q3 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PAN2Q504Q3 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PAN2Q504Q3 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PAN2Q504Q3 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PAN2Q504Q3 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PAN2Q504Q3 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PAN2Q504Q3 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PAN2Q504Q3 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PAN2Q504Q3 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PAN2Q504Q3 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PAN2Q504Q3 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PAN2Q504Q3 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PAN2Q504Q3 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PAN2Q504Q3 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PAN2Q504Q3 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PAN2Q504Q3 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PAN2Q504Q3 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PAN2Q504Q3 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PAN2Q504Q3 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PAN2Q504Q3 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PAN2Q504Q3 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
PAN2Q504Q3 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PAN2Q504Q3 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PAN2Q504Q3 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PAN2Q504Q3 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
PAN2Q504Q3 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PAN2Q504Q3 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PAN2Q504Q3 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PAN2Q504Q3 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PAN2Q504Q3 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
PAN2Q504Q3 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PAN2Q504Q3 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PAN2Q504Q3 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PAN2Q504Q3 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
PAN2Q504Q3 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
PAN2Q504Q3 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PAN2Q504Q3 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PAN2Q504Q3 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PAN2Q504Q3 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PAN2Q504Q3 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PAN2Q504Q3 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PAN2Q504Q3 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PAN2Q504Q3 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PAN2Q504Q3 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PAN2Q504Q3 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PAN2Q504Q3 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PAN2Q504Q3 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PAN2Q504Q3 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PAN2Q504Q3 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
PAN2Q504Q3 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
PAN2Q504Q3 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PAN2Q504Q3 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PAN2Q504Q3 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PAN2Q504Q3 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PAN2Q504Q3 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PAN2Q504Q3 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PAN2Q504Q3 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PAN2Q504Q3 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PAN2Q504Q3 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PAN2Q504Q3 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PAN2Q504Q3 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PAN2Q504Q3 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PAN2Q504Q3 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PAN2Q504Q3 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PAN2Q504Q3 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PAN2Q504Q3 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PAN2Q504Q3 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PAN2Q504Q3 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PAN2Q504Q3 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PAN2Q504Q3 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
PAN2Q504Q3 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PAN2Q504Q3 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PAN2Q504Q3 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PAN2Q504Q3 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PAN2Q504Q3 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PAN2Q504Q3 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PAN2Q504Q3 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PAN2Q504Q3 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PAN2Q504Q3 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PAN2Q504Q3 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
PAN2Q504Q3 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PAN2Q504Q3 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PAN2Q504Q3 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
PAN2Q504Q3 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PAN2Q504Q3 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
PAN2Q504Q3 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PAN2Q504Q3 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PAN2Q504Q3 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PAN2Q504Q3 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms