Protein–RNA interactions for Protein: Q502W7

CCDC38, Coiled-coil domain-containing protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC38Q502W7 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC38Q502W7 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC38Q502W7 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC38Q502W7 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC38Q502W7 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC38Q502W7 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC38Q502W7 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC38Q502W7 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC38Q502W7 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC38Q502W7 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC38Q502W7 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC38Q502W7 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC38Q502W7 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC38Q502W7 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC38Q502W7 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC38Q502W7 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC38Q502W7 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC38Q502W7 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC38Q502W7 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC38Q502W7 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC38Q502W7 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC38Q502W7 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC38Q502W7 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC38Q502W7 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC38Q502W7 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC38Q502W7 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC38Q502W7 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC38Q502W7 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC38Q502W7 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC38Q502W7 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC38Q502W7 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC38Q502W7 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC38Q502W7 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC38Q502W7 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC38Q502W7 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC38Q502W7 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC38Q502W7 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC38Q502W7 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC38Q502W7 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC38Q502W7 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC38Q502W7 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC38Q502W7 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC38Q502W7 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC38Q502W7 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC38Q502W7 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC38Q502W7 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC38Q502W7 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC38Q502W7 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC38Q502W7 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC38Q502W7 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC38Q502W7 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC38Q502W7 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC38Q502W7 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC38Q502W7 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC38Q502W7 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC38Q502W7 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC38Q502W7 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC38Q502W7 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC38Q502W7 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC38Q502W7 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC38Q502W7 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC38Q502W7 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC38Q502W7 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC38Q502W7 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC38Q502W7 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC38Q502W7 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC38Q502W7 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC38Q502W7 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC38Q502W7 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC38Q502W7 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC38Q502W7 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC38Q502W7 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC38Q502W7 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CCDC38Q502W7 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CCDC38Q502W7 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CCDC38Q502W7 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CCDC38Q502W7 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CCDC38Q502W7 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CCDC38Q502W7 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CCDC38Q502W7 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CCDC38Q502W7 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CCDC38Q502W7 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC38Q502W7 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC38Q502W7 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC38Q502W7 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC38Q502W7 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC38Q502W7 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC38Q502W7 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC38Q502W7 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC38Q502W7 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC38Q502W7 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC38Q502W7 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC38Q502W7 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC38Q502W7 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC38Q502W7 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC38Q502W7 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC38Q502W7 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC38Q502W7 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC38Q502W7 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC38Q502W7 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms