Protein–RNA interactions for Protein: Q496Y0

LONRF3, LON peptidase N-terminal domain and RING finger protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 759 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LONRF3Q496Y0 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
LONRF3Q496Y0 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LONRF3Q496Y0 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LONRF3Q496Y0 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LONRF3Q496Y0 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LONRF3Q496Y0 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LONRF3Q496Y0 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LONRF3Q496Y0 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LONRF3Q496Y0 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LONRF3Q496Y0 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LONRF3Q496Y0 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LONRF3Q496Y0 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
LONRF3Q496Y0 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LONRF3Q496Y0 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LONRF3Q496Y0 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LONRF3Q496Y0 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LONRF3Q496Y0 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LONRF3Q496Y0 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LONRF3Q496Y0 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
LONRF3Q496Y0 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LONRF3Q496Y0 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LONRF3Q496Y0 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
LONRF3Q496Y0 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LONRF3Q496Y0 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LONRF3Q496Y0 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LONRF3Q496Y0 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LONRF3Q496Y0 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LONRF3Q496Y0 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LONRF3Q496Y0 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LONRF3Q496Y0 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LONRF3Q496Y0 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LONRF3Q496Y0 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LONRF3Q496Y0 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LONRF3Q496Y0 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LONRF3Q496Y0 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LONRF3Q496Y0 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
LONRF3Q496Y0 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LONRF3Q496Y0 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LONRF3Q496Y0 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
LONRF3Q496Y0 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LONRF3Q496Y0 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LONRF3Q496Y0 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LONRF3Q496Y0 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LONRF3Q496Y0 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LONRF3Q496Y0 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LONRF3Q496Y0 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LONRF3Q496Y0 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
LONRF3Q496Y0 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
LONRF3Q496Y0 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
LONRF3Q496Y0 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
LONRF3Q496Y0 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
LONRF3Q496Y0 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
LONRF3Q496Y0 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LONRF3Q496Y0 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LONRF3Q496Y0 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LONRF3Q496Y0 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LONRF3Q496Y0 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LONRF3Q496Y0 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LONRF3Q496Y0 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LONRF3Q496Y0 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LONRF3Q496Y0 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LONRF3Q496Y0 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LONRF3Q496Y0 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LONRF3Q496Y0 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LONRF3Q496Y0 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LONRF3Q496Y0 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LONRF3Q496Y0 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LONRF3Q496Y0 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LONRF3Q496Y0 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LONRF3Q496Y0 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LONRF3Q496Y0 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LONRF3Q496Y0 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LONRF3Q496Y0 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
LONRF3Q496Y0 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LONRF3Q496Y0 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LONRF3Q496Y0 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LONRF3Q496Y0 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LONRF3Q496Y0 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LONRF3Q496Y0 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LONRF3Q496Y0 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LONRF3Q496Y0 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LONRF3Q496Y0 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LONRF3Q496Y0 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LONRF3Q496Y0 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LONRF3Q496Y0 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LONRF3Q496Y0 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LONRF3Q496Y0 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LONRF3Q496Y0 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LONRF3Q496Y0 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LONRF3Q496Y0 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LONRF3Q496Y0 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LONRF3Q496Y0 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LONRF3Q496Y0 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LONRF3Q496Y0 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LONRF3Q496Y0 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LONRF3Q496Y0 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LONRF3Q496Y0 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LONRF3Q496Y0 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LONRF3Q496Y0 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LONRF3Q496Y0 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms