Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI61

KRTAP20-2, Keratin-associated protein 20-2, humanhuman

Predictions only

Length 65 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP20-2Q3LI61 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP20-2Q3LI61 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP20-2Q3LI61 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP20-2Q3LI61 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP20-2Q3LI61 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP20-2Q3LI61 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP20-2Q3LI61 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP20-2Q3LI61 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP20-2Q3LI61 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP20-2Q3LI61 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP20-2Q3LI61 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP20-2Q3LI61 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP20-2Q3LI61 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP20-2Q3LI61 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP20-2Q3LI61 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP20-2Q3LI61 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP20-2Q3LI61 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
KRTAP20-2Q3LI61 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
KRTAP20-2Q3LI61 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
KRTAP20-2Q3LI61 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
KRTAP20-2Q3LI61 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
KRTAP20-2Q3LI61 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
KRTAP20-2Q3LI61 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
KRTAP20-2Q3LI61 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
KRTAP20-2Q3LI61 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
KRTAP20-2Q3LI61 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
KRTAP20-2Q3LI61 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
KRTAP20-2Q3LI61 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
KRTAP20-2Q3LI61 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
KRTAP20-2Q3LI61 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
KRTAP20-2Q3LI61 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
KRTAP20-2Q3LI61 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
KRTAP20-2Q3LI61 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
KRTAP20-2Q3LI61 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
KRTAP20-2Q3LI61 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
KRTAP20-2Q3LI61 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
KRTAP20-2Q3LI61 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
KRTAP20-2Q3LI61 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
KRTAP20-2Q3LI61 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
KRTAP20-2Q3LI61 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
KRTAP20-2Q3LI61 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
KRTAP20-2Q3LI61 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
KRTAP20-2Q3LI61 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC5.86□□□□□ -1.47
KRTAP20-2Q3LI61 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
KRTAP20-2Q3LI61 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
KRTAP20-2Q3LI61 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
KRTAP20-2Q3LI61 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
KRTAP20-2Q3LI61 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
KRTAP20-2Q3LI61 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
KRTAP20-2Q3LI61 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
KRTAP20-2Q3LI61 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
KRTAP20-2Q3LI61 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
KRTAP20-2Q3LI61 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.86□□□□□ -1.47
KRTAP20-2Q3LI61 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
KRTAP20-2Q3LI61 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
KRTAP20-2Q3LI61 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
KRTAP20-2Q3LI61 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
KRTAP20-2Q3LI61 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
KRTAP20-2Q3LI61 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
KRTAP20-2Q3LI61 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
KRTAP20-2Q3LI61 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
KRTAP20-2Q3LI61 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
KRTAP20-2Q3LI61 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP20-2Q3LI61 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP20-2Q3LI61 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP20-2Q3LI61 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP20-2Q3LI61 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP20-2Q3LI61 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP20-2Q3LI61 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP20-2Q3LI61 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP20-2Q3LI61 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP20-2Q3LI61 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP20-2Q3LI61 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP20-2Q3LI61 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP20-2Q3LI61 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP20-2Q3LI61 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP20-2Q3LI61 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP20-2Q3LI61 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP20-2Q3LI61 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP20-2Q3LI61 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP20-2Q3LI61 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP20-2Q3LI61 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP20-2Q3LI61 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP20-2Q3LI61 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP20-2Q3LI61 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP20-2Q3LI61 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP20-2Q3LI61 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP20-2Q3LI61 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP20-2Q3LI61 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP20-2Q3LI61 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP20-2Q3LI61 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP20-2Q3LI61 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP20-2Q3LI61 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP20-2Q3LI61 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP20-2Q3LI61 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP20-2Q3LI61 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP20-2Q3LI61 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP20-2Q3LI61 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP20-2Q3LI61 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP20-2Q3LI61 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms