Protein–RNA interactions for Protein: Q2VWA4

SKOR2, SKI family transcriptional corepressor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKOR2Q2VWA4 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SKOR2Q2VWA4 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SKOR2Q2VWA4 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SKOR2Q2VWA4 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SKOR2Q2VWA4 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SKOR2Q2VWA4 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SKOR2Q2VWA4 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SKOR2Q2VWA4 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SKOR2Q2VWA4 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SKOR2Q2VWA4 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SKOR2Q2VWA4 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SKOR2Q2VWA4 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SKOR2Q2VWA4 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SKOR2Q2VWA4 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SKOR2Q2VWA4 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SKOR2Q2VWA4 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SKOR2Q2VWA4 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SKOR2Q2VWA4 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SKOR2Q2VWA4 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SKOR2Q2VWA4 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SKOR2Q2VWA4 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SKOR2Q2VWA4 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SKOR2Q2VWA4 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SKOR2Q2VWA4 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SKOR2Q2VWA4 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SKOR2Q2VWA4 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SKOR2Q2VWA4 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SKOR2Q2VWA4 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SKOR2Q2VWA4 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SKOR2Q2VWA4 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SKOR2Q2VWA4 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SKOR2Q2VWA4 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SKOR2Q2VWA4 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SKOR2Q2VWA4 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SKOR2Q2VWA4 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SKOR2Q2VWA4 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SKOR2Q2VWA4 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SKOR2Q2VWA4 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SKOR2Q2VWA4 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SKOR2Q2VWA4 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SKOR2Q2VWA4 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SKOR2Q2VWA4 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SKOR2Q2VWA4 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SKOR2Q2VWA4 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SKOR2Q2VWA4 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SKOR2Q2VWA4 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SKOR2Q2VWA4 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SKOR2Q2VWA4 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SKOR2Q2VWA4 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SKOR2Q2VWA4 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SKOR2Q2VWA4 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SKOR2Q2VWA4 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SKOR2Q2VWA4 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SKOR2Q2VWA4 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SKOR2Q2VWA4 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SKOR2Q2VWA4 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SKOR2Q2VWA4 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SKOR2Q2VWA4 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SKOR2Q2VWA4 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SKOR2Q2VWA4 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SKOR2Q2VWA4 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SKOR2Q2VWA4 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SKOR2Q2VWA4 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SKOR2Q2VWA4 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SKOR2Q2VWA4 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SKOR2Q2VWA4 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SKOR2Q2VWA4 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SKOR2Q2VWA4 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SKOR2Q2VWA4 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SKOR2Q2VWA4 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SKOR2Q2VWA4 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SKOR2Q2VWA4 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SKOR2Q2VWA4 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SKOR2Q2VWA4 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SKOR2Q2VWA4 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SKOR2Q2VWA4 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SKOR2Q2VWA4 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SKOR2Q2VWA4 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SKOR2Q2VWA4 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SKOR2Q2VWA4 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SKOR2Q2VWA4 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SKOR2Q2VWA4 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SKOR2Q2VWA4 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SKOR2Q2VWA4 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SKOR2Q2VWA4 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
SKOR2Q2VWA4 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
SKOR2Q2VWA4 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SKOR2Q2VWA4 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SKOR2Q2VWA4 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SKOR2Q2VWA4 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SKOR2Q2VWA4 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SKOR2Q2VWA4 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SKOR2Q2VWA4 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SKOR2Q2VWA4 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SKOR2Q2VWA4 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SKOR2Q2VWA4 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SKOR2Q2VWA4 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SKOR2Q2VWA4 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SKOR2Q2VWA4 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SKOR2Q2VWA4 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms