Protein–RNA interactions for Protein: Q2M2W7

C17orf58, UPF0450 protein C17orf58, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C17orf58Q2M2W7 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
C17orf58Q2M2W7 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C17orf58Q2M2W7 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
C17orf58Q2M2W7 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
C17orf58Q2M2W7 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
C17orf58Q2M2W7 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C17orf58Q2M2W7 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
C17orf58Q2M2W7 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
C17orf58Q2M2W7 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
C17orf58Q2M2W7 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
C17orf58Q2M2W7 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
C17orf58Q2M2W7 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
C17orf58Q2M2W7 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C17orf58Q2M2W7 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
C17orf58Q2M2W7 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
C17orf58Q2M2W7 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C17orf58Q2M2W7 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C17orf58Q2M2W7 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C17orf58Q2M2W7 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
C17orf58Q2M2W7 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C17orf58Q2M2W7 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
C17orf58Q2M2W7 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C17orf58Q2M2W7 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
C17orf58Q2M2W7 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
C17orf58Q2M2W7 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
C17orf58Q2M2W7 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
C17orf58Q2M2W7 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
C17orf58Q2M2W7 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
C17orf58Q2M2W7 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C17orf58Q2M2W7 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
C17orf58Q2M2W7 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C17orf58Q2M2W7 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C17orf58Q2M2W7 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
C17orf58Q2M2W7 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C17orf58Q2M2W7 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
C17orf58Q2M2W7 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
C17orf58Q2M2W7 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
C17orf58Q2M2W7 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C17orf58Q2M2W7 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C17orf58Q2M2W7 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C17orf58Q2M2W7 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C17orf58Q2M2W7 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
C17orf58Q2M2W7 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C17orf58Q2M2W7 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
C17orf58Q2M2W7 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
C17orf58Q2M2W7 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C17orf58Q2M2W7 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
C17orf58Q2M2W7 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C17orf58Q2M2W7 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
C17orf58Q2M2W7 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
C17orf58Q2M2W7 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
C17orf58Q2M2W7 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
C17orf58Q2M2W7 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C17orf58Q2M2W7 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C17orf58Q2M2W7 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
C17orf58Q2M2W7 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C17orf58Q2M2W7 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
C17orf58Q2M2W7 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C17orf58Q2M2W7 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
C17orf58Q2M2W7 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C17orf58Q2M2W7 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
C17orf58Q2M2W7 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C17orf58Q2M2W7 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
C17orf58Q2M2W7 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C17orf58Q2M2W7 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C17orf58Q2M2W7 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
C17orf58Q2M2W7 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
C17orf58Q2M2W7 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
C17orf58Q2M2W7 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
C17orf58Q2M2W7 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
C17orf58Q2M2W7 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
C17orf58Q2M2W7 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
C17orf58Q2M2W7 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
C17orf58Q2M2W7 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C17orf58Q2M2W7 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C17orf58Q2M2W7 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
C17orf58Q2M2W7 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C17orf58Q2M2W7 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C17orf58Q2M2W7 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
C17orf58Q2M2W7 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C17orf58Q2M2W7 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
C17orf58Q2M2W7 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
C17orf58Q2M2W7 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C17orf58Q2M2W7 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C17orf58Q2M2W7 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C17orf58Q2M2W7 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C17orf58Q2M2W7 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C17orf58Q2M2W7 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C17orf58Q2M2W7 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C17orf58Q2M2W7 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C17orf58Q2M2W7 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
C17orf58Q2M2W7 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
C17orf58Q2M2W7 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C17orf58Q2M2W7 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C17orf58Q2M2W7 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C17orf58Q2M2W7 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C17orf58Q2M2W7 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C17orf58Q2M2W7 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C17orf58Q2M2W7 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C17orf58Q2M2W7 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms