Protein–RNA interactions for Protein: Q16795

NDUFA9, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 9, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFA9Q16795 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
NDUFA9Q16795 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
NDUFA9Q16795 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
NDUFA9Q16795 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
NDUFA9Q16795 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
NDUFA9Q16795 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NDUFA9Q16795 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NDUFA9Q16795 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
NDUFA9Q16795 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NDUFA9Q16795 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
NDUFA9Q16795 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
NDUFA9Q16795 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NDUFA9Q16795 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
NDUFA9Q16795 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NDUFA9Q16795 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NDUFA9Q16795 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NDUFA9Q16795 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NDUFA9Q16795 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NDUFA9Q16795 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NDUFA9Q16795 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NDUFA9Q16795 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NDUFA9Q16795 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NDUFA9Q16795 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NDUFA9Q16795 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NDUFA9Q16795 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NDUFA9Q16795 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NDUFA9Q16795 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NDUFA9Q16795 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NDUFA9Q16795 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NDUFA9Q16795 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
NDUFA9Q16795 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NDUFA9Q16795 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NDUFA9Q16795 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NDUFA9Q16795 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NDUFA9Q16795 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NDUFA9Q16795 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NDUFA9Q16795 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NDUFA9Q16795 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NDUFA9Q16795 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NDUFA9Q16795 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NDUFA9Q16795 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NDUFA9Q16795 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NDUFA9Q16795 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NDUFA9Q16795 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NDUFA9Q16795 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NDUFA9Q16795 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NDUFA9Q16795 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NDUFA9Q16795 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NDUFA9Q16795 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NDUFA9Q16795 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NDUFA9Q16795 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NDUFA9Q16795 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NDUFA9Q16795 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NDUFA9Q16795 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NDUFA9Q16795 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NDUFA9Q16795 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
NDUFA9Q16795 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
NDUFA9Q16795 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NDUFA9Q16795 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NDUFA9Q16795 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NDUFA9Q16795 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NDUFA9Q16795 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
NDUFA9Q16795 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NDUFA9Q16795 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NDUFA9Q16795 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NDUFA9Q16795 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NDUFA9Q16795 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NDUFA9Q16795 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NDUFA9Q16795 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NDUFA9Q16795 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NDUFA9Q16795 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NDUFA9Q16795 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NDUFA9Q16795 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NDUFA9Q16795 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NDUFA9Q16795 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NDUFA9Q16795 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NDUFA9Q16795 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
NDUFA9Q16795 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NDUFA9Q16795 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NDUFA9Q16795 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
NDUFA9Q16795 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NDUFA9Q16795 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NDUFA9Q16795 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NDUFA9Q16795 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NDUFA9Q16795 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NDUFA9Q16795 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NDUFA9Q16795 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NDUFA9Q16795 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NDUFA9Q16795 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NDUFA9Q16795 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NDUFA9Q16795 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NDUFA9Q16795 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NDUFA9Q16795 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NDUFA9Q16795 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NDUFA9Q16795 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NDUFA9Q16795 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NDUFA9Q16795 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NDUFA9Q16795 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NDUFA9Q16795 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NDUFA9Q16795 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms