Protein–RNA interactions for Protein: Q16787

LAMA3, Laminin subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 3,333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA3Q16787 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LAMA3Q16787 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LAMA3Q16787 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LAMA3Q16787 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LAMA3Q16787 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LAMA3Q16787 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LAMA3Q16787 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LAMA3Q16787 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LAMA3Q16787 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LAMA3Q16787 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LAMA3Q16787 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LAMA3Q16787 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LAMA3Q16787 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
LAMA3Q16787 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LAMA3Q16787 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LAMA3Q16787 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LAMA3Q16787 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LAMA3Q16787 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LAMA3Q16787 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LAMA3Q16787 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LAMA3Q16787 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
LAMA3Q16787 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LAMA3Q16787 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LAMA3Q16787 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LAMA3Q16787 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LAMA3Q16787 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LAMA3Q16787 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LAMA3Q16787 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LAMA3Q16787 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LAMA3Q16787 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LAMA3Q16787 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
LAMA3Q16787 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LAMA3Q16787 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LAMA3Q16787 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LAMA3Q16787 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LAMA3Q16787 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LAMA3Q16787 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
LAMA3Q16787 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LAMA3Q16787 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
LAMA3Q16787 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
LAMA3Q16787 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
LAMA3Q16787 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LAMA3Q16787 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LAMA3Q16787 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LAMA3Q16787 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
LAMA3Q16787 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LAMA3Q16787 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
LAMA3Q16787 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LAMA3Q16787 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LAMA3Q16787 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
LAMA3Q16787 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
LAMA3Q16787 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
LAMA3Q16787 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
LAMA3Q16787 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
LAMA3Q16787 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
LAMA3Q16787 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
LAMA3Q16787 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
LAMA3Q16787 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
LAMA3Q16787 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
LAMA3Q16787 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
LAMA3Q16787 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
LAMA3Q16787 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
LAMA3Q16787 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
LAMA3Q16787 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
LAMA3Q16787 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
LAMA3Q16787 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
LAMA3Q16787 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
LAMA3Q16787 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
LAMA3Q16787 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
LAMA3Q16787 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LAMA3Q16787 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LAMA3Q16787 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LAMA3Q16787 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LAMA3Q16787 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LAMA3Q16787 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LAMA3Q16787 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LAMA3Q16787 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LAMA3Q16787 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LAMA3Q16787 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LAMA3Q16787 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LAMA3Q16787 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LAMA3Q16787 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LAMA3Q16787 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LAMA3Q16787 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LAMA3Q16787 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LAMA3Q16787 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LAMA3Q16787 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LAMA3Q16787 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LAMA3Q16787 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LAMA3Q16787 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LAMA3Q16787 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LAMA3Q16787 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LAMA3Q16787 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
LAMA3Q16787 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LAMA3Q16787 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LAMA3Q16787 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LAMA3Q16787 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LAMA3Q16787 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LAMA3Q16787 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LAMA3Q16787 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
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