Protein–RNA interactions for Protein: Q16654

PDK4, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 4, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK4Q16654 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PDK4Q16654 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PDK4Q16654 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PDK4Q16654 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PDK4Q16654 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PDK4Q16654 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PDK4Q16654 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PDK4Q16654 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PDK4Q16654 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PDK4Q16654 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PDK4Q16654 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PDK4Q16654 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PDK4Q16654 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PDK4Q16654 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PDK4Q16654 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
PDK4Q16654 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PDK4Q16654 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PDK4Q16654 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PDK4Q16654 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PDK4Q16654 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PDK4Q16654 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PDK4Q16654 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PDK4Q16654 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PDK4Q16654 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
PDK4Q16654 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PDK4Q16654 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PDK4Q16654 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PDK4Q16654 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PDK4Q16654 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PDK4Q16654 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
PDK4Q16654 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PDK4Q16654 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PDK4Q16654 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PDK4Q16654 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PDK4Q16654 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PDK4Q16654 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PDK4Q16654 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PDK4Q16654 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PDK4Q16654 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PDK4Q16654 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PDK4Q16654 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PDK4Q16654 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PDK4Q16654 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PDK4Q16654 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PDK4Q16654 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PDK4Q16654 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PDK4Q16654 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PDK4Q16654 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PDK4Q16654 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
PDK4Q16654 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PDK4Q16654 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PDK4Q16654 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PDK4Q16654 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PDK4Q16654 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PDK4Q16654 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PDK4Q16654 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PDK4Q16654 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PDK4Q16654 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PDK4Q16654 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PDK4Q16654 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PDK4Q16654 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PDK4Q16654 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PDK4Q16654 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PDK4Q16654 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PDK4Q16654 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PDK4Q16654 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PDK4Q16654 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PDK4Q16654 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PDK4Q16654 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PDK4Q16654 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PDK4Q16654 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PDK4Q16654 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PDK4Q16654 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
PDK4Q16654 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PDK4Q16654 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PDK4Q16654 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PDK4Q16654 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PDK4Q16654 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PDK4Q16654 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PDK4Q16654 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PDK4Q16654 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PDK4Q16654 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PDK4Q16654 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PDK4Q16654 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PDK4Q16654 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PDK4Q16654 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PDK4Q16654 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PDK4Q16654 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PDK4Q16654 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PDK4Q16654 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PDK4Q16654 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PDK4Q16654 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PDK4Q16654 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PDK4Q16654 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PDK4Q16654 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PDK4Q16654 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PDK4Q16654 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PDK4Q16654 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PDK4Q16654 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PDK4Q16654 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
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