Protein–RNA interactions for Protein: Q16595

FXN, Frataxin, mitochondrial, humanhuman

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Length 210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FXNQ16595 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
FXNQ16595 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
FXNQ16595 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
FXNQ16595 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
FXNQ16595 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
FXNQ16595 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
FXNQ16595 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
FXNQ16595 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
FXNQ16595 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
FXNQ16595 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
FXNQ16595 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
FXNQ16595 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
FXNQ16595 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
FXNQ16595 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
FXNQ16595 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
FXNQ16595 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
FXNQ16595 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
FXNQ16595 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
FXNQ16595 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
FXNQ16595 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
FXNQ16595 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
FXNQ16595 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
FXNQ16595 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
FXNQ16595 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
FXNQ16595 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
FXNQ16595 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
FXNQ16595 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
FXNQ16595 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
FXNQ16595 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
FXNQ16595 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
FXNQ16595 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
FXNQ16595 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
FXNQ16595 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
FXNQ16595 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
FXNQ16595 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
FXNQ16595 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
FXNQ16595 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
FXNQ16595 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
FXNQ16595 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
FXNQ16595 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
FXNQ16595 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
FXNQ16595 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
FXNQ16595 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
FXNQ16595 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
FXNQ16595 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
FXNQ16595 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
FXNQ16595 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
FXNQ16595 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
FXNQ16595 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
FXNQ16595 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
FXNQ16595 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.66■□□□□ 0.58
FXNQ16595 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
FXNQ16595 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
FXNQ16595 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
FXNQ16595 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
FXNQ16595 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
FXNQ16595 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC18.66■□□□□ 0.58
FXNQ16595 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
FXNQ16595 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
FXNQ16595 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
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FXNQ16595 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
FXNQ16595 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
FXNQ16595 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
FXNQ16595 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
FXNQ16595 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
FXNQ16595 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
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FXNQ16595 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
FXNQ16595 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
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FXNQ16595 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
FXNQ16595 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
FXNQ16595 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
FXNQ16595 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
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FXNQ16595 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
FXNQ16595 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
FXNQ16595 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
FXNQ16595 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
FXNQ16595 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
FXNQ16595 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
FXNQ16595 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
FXNQ16595 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
FXNQ16595 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
FXNQ16595 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
FXNQ16595 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
FXNQ16595 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
FXNQ16595 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
FXNQ16595 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
FXNQ16595 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
FXNQ16595 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
FXNQ16595 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
FXNQ16595 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
FXNQ16595 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
FXNQ16595 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
FXNQ16595 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
FXNQ16595 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
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