Protein–RNA interactions for Protein: Q16445

GABRA6, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-6, humanhuman

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Length 453 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA6Q16445 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GABRA6Q16445 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GABRA6Q16445 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GABRA6Q16445 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GABRA6Q16445 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GABRA6Q16445 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GABRA6Q16445 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GABRA6Q16445 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GABRA6Q16445 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GABRA6Q16445 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GABRA6Q16445 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GABRA6Q16445 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GABRA6Q16445 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GABRA6Q16445 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GABRA6Q16445 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GABRA6Q16445 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GABRA6Q16445 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GABRA6Q16445 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GABRA6Q16445 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GABRA6Q16445 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GABRA6Q16445 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GABRA6Q16445 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GABRA6Q16445 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GABRA6Q16445 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GABRA6Q16445 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GABRA6Q16445 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GABRA6Q16445 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GABRA6Q16445 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GABRA6Q16445 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GABRA6Q16445 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GABRA6Q16445 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GABRA6Q16445 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GABRA6Q16445 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GABRA6Q16445 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GABRA6Q16445 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
GABRA6Q16445 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GABRA6Q16445 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GABRA6Q16445 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GABRA6Q16445 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
GABRA6Q16445 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
GABRA6Q16445 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GABRA6Q16445 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GABRA6Q16445 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GABRA6Q16445 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GABRA6Q16445 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GABRA6Q16445 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GABRA6Q16445 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GABRA6Q16445 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GABRA6Q16445 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GABRA6Q16445 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GABRA6Q16445 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GABRA6Q16445 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GABRA6Q16445 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GABRA6Q16445 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GABRA6Q16445 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GABRA6Q16445 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GABRA6Q16445 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GABRA6Q16445 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GABRA6Q16445 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GABRA6Q16445 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GABRA6Q16445 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GABRA6Q16445 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GABRA6Q16445 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GABRA6Q16445 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GABRA6Q16445 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GABRA6Q16445 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GABRA6Q16445 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GABRA6Q16445 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GABRA6Q16445 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GABRA6Q16445 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GABRA6Q16445 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GABRA6Q16445 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GABRA6Q16445 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GABRA6Q16445 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GABRA6Q16445 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GABRA6Q16445 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GABRA6Q16445 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
GABRA6Q16445 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GABRA6Q16445 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GABRA6Q16445 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GABRA6Q16445 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GABRA6Q16445 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GABRA6Q16445 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GABRA6Q16445 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GABRA6Q16445 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GABRA6Q16445 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GABRA6Q16445 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GABRA6Q16445 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GABRA6Q16445 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GABRA6Q16445 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GABRA6Q16445 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GABRA6Q16445 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GABRA6Q16445 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GABRA6Q16445 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GABRA6Q16445 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GABRA6Q16445 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GABRA6Q16445 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GABRA6Q16445 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GABRA6Q16445 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GABRA6Q16445 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
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