Protein–RNA interactions for Protein: Q16143

SNCB, Beta-synuclein, humanhuman

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNCBQ16143 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SNCBQ16143 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SNCBQ16143 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SNCBQ16143 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SNCBQ16143 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SNCBQ16143 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SNCBQ16143 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SNCBQ16143 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SNCBQ16143 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SNCBQ16143 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SNCBQ16143 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SNCBQ16143 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.7
SNCBQ16143 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SNCBQ16143 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SNCBQ16143 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SNCBQ16143 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SNCBQ16143 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SNCBQ16143 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SNCBQ16143 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SNCBQ16143 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SNCBQ16143 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SNCBQ16143 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SNCBQ16143 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
SNCBQ16143 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SNCBQ16143 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SNCBQ16143 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SNCBQ16143 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SNCBQ16143 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SNCBQ16143 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SNCBQ16143 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SNCBQ16143 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SNCBQ16143 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SNCBQ16143 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SNCBQ16143 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SNCBQ16143 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SNCBQ16143 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SNCBQ16143 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SNCBQ16143 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SNCBQ16143 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SNCBQ16143 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SNCBQ16143 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SNCBQ16143 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SNCBQ16143 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SNCBQ16143 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SNCBQ16143 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SNCBQ16143 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SNCBQ16143 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SNCBQ16143 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SNCBQ16143 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SNCBQ16143 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SNCBQ16143 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SNCBQ16143 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SNCBQ16143 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SNCBQ16143 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SNCBQ16143 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SNCBQ16143 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SNCBQ16143 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SNCBQ16143 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
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SNCBQ16143 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SNCBQ16143 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SNCBQ16143 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SNCBQ16143 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SNCBQ16143 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SNCBQ16143 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SNCBQ16143 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SNCBQ16143 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SNCBQ16143 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SNCBQ16143 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SNCBQ16143 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SNCBQ16143 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
SNCBQ16143 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
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SNCBQ16143 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SNCBQ16143 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
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SNCBQ16143 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SNCBQ16143 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
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SNCBQ16143 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
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SNCBQ16143 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
SNCBQ16143 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SNCBQ16143 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SNCBQ16143 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SNCBQ16143 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SNCBQ16143 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
SNCBQ16143 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SNCBQ16143 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC19.42■□□□□ 0.7
SNCBQ16143 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SNCBQ16143 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
SNCBQ16143 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SNCBQ16143 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
SNCBQ16143 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
SNCBQ16143 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
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