Protein–RNA interactions for Protein: Q15788

NCOA1, Nuclear receptor coactivator 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,441 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA1Q15788 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
NCOA1Q15788 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
NCOA1Q15788 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.92■■■□□ 2.38
NCOA1Q15788 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
NCOA1Q15788 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC29.92■■■□□ 2.38
NCOA1Q15788 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
NCOA1Q15788 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
NCOA1Q15788 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
NCOA1Q15788 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC29.92■■■□□ 2.38
NCOA1Q15788 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
NCOA1Q15788 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
NCOA1Q15788 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
NCOA1Q15788 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
NCOA1Q15788 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
NCOA1Q15788 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC29.91■■■□□ 2.38
NCOA1Q15788 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
NCOA1Q15788 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
NCOA1Q15788 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
NCOA1Q15788 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC29.91■■■□□ 2.38
NCOA1Q15788 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
NCOA1Q15788 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
NCOA1Q15788 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
NCOA1Q15788 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
NCOA1Q15788 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
NCOA1Q15788 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
NCOA1Q15788 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
NCOA1Q15788 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
NCOA1Q15788 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
NCOA1Q15788 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
NCOA1Q15788 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
NCOA1Q15788 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
NCOA1Q15788 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
NCOA1Q15788 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
NCOA1Q15788 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
NCOA1Q15788 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
NCOA1Q15788 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC29.89■■■□□ 2.38
NCOA1Q15788 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
NCOA1Q15788 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
NCOA1Q15788 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
NCOA1Q15788 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
NCOA1Q15788 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
NCOA1Q15788 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
NCOA1Q15788 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
NCOA1Q15788 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.37
NCOA1Q15788 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
NCOA1Q15788 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
NCOA1Q15788 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
NCOA1Q15788 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
NCOA1Q15788 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
NCOA1Q15788 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
NCOA1Q15788 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC29.88■■■□□ 2.37
NCOA1Q15788 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC29.88■■■□□ 2.37
NCOA1Q15788 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
NCOA1Q15788 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
NCOA1Q15788 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
NCOA1Q15788 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
NCOA1Q15788 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
NCOA1Q15788 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
NCOA1Q15788 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
NCOA1Q15788 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
NCOA1Q15788 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC29.88■■■□□ 2.37
NCOA1Q15788 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
NCOA1Q15788 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
NCOA1Q15788 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
NCOA1Q15788 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
NCOA1Q15788 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
NCOA1Q15788 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
NCOA1Q15788 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
NCOA1Q15788 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC29.87■■■□□ 2.37
NCOA1Q15788 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
NCOA1Q15788 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
NCOA1Q15788 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
NCOA1Q15788 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
NCOA1Q15788 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
NCOA1Q15788 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
NCOA1Q15788 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
NCOA1Q15788 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
NCOA1Q15788 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC29.86■■■□□ 2.37
NCOA1Q15788 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
NCOA1Q15788 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
NCOA1Q15788 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
NCOA1Q15788 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
NCOA1Q15788 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
NCOA1Q15788 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
NCOA1Q15788 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC29.86■■■□□ 2.37
NCOA1Q15788 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
NCOA1Q15788 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
NCOA1Q15788 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
NCOA1Q15788 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
NCOA1Q15788 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
NCOA1Q15788 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
NCOA1Q15788 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
NCOA1Q15788 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
NCOA1Q15788 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
NCOA1Q15788 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
NCOA1Q15788 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC29.85■■■□□ 2.37
NCOA1Q15788 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC29.85■■■□□ 2.37
NCOA1Q15788 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
NCOA1Q15788 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
NCOA1Q15788 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms