Protein–RNA interactions for Protein: Q15699

ALX1, ALX homeobox protein 1, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALX1Q15699 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ALX1Q15699 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ALX1Q15699 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ALX1Q15699 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ALX1Q15699 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
ALX1Q15699 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ALX1Q15699 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
ALX1Q15699 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
ALX1Q15699 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ALX1Q15699 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ALX1Q15699 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ALX1Q15699 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ALX1Q15699 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ALX1Q15699 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ALX1Q15699 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ALX1Q15699 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ALX1Q15699 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ALX1Q15699 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ALX1Q15699 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ALX1Q15699 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ALX1Q15699 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ALX1Q15699 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ALX1Q15699 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ALX1Q15699 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ALX1Q15699 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ALX1Q15699 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ALX1Q15699 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ALX1Q15699 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ALX1Q15699 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ALX1Q15699 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ALX1Q15699 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ALX1Q15699 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ALX1Q15699 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ALX1Q15699 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ALX1Q15699 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ALX1Q15699 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ALX1Q15699 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ALX1Q15699 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ALX1Q15699 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ALX1Q15699 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ALX1Q15699 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ALX1Q15699 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ALX1Q15699 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ALX1Q15699 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ALX1Q15699 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ALX1Q15699 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ALX1Q15699 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
ALX1Q15699 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ALX1Q15699 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ALX1Q15699 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ALX1Q15699 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ALX1Q15699 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ALX1Q15699 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ALX1Q15699 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ALX1Q15699 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ALX1Q15699 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ALX1Q15699 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ALX1Q15699 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ALX1Q15699 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ALX1Q15699 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ALX1Q15699 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ALX1Q15699 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ALX1Q15699 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ALX1Q15699 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ALX1Q15699 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ALX1Q15699 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ALX1Q15699 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ALX1Q15699 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ALX1Q15699 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ALX1Q15699 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
ALX1Q15699 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ALX1Q15699 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ALX1Q15699 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ALX1Q15699 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ALX1Q15699 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ALX1Q15699 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
ALX1Q15699 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
ALX1Q15699 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
ALX1Q15699 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
ALX1Q15699 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
ALX1Q15699 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ALX1Q15699 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ALX1Q15699 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ALX1Q15699 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ALX1Q15699 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ALX1Q15699 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ALX1Q15699 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
ALX1Q15699 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ALX1Q15699 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ALX1Q15699 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ALX1Q15699 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ALX1Q15699 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
ALX1Q15699 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ALX1Q15699 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ALX1Q15699 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ALX1Q15699 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ALX1Q15699 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ALX1Q15699 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ALX1Q15699 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ALX1Q15699 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
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