Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SIX1Q15475 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
SIX1Q15475 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SIX1Q15475 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SIX1Q15475 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SIX1Q15475 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SIX1Q15475 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SIX1Q15475 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SIX1Q15475 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SIX1Q15475 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SIX1Q15475 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SIX1Q15475 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SIX1Q15475 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SIX1Q15475 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SIX1Q15475 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SIX1Q15475 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SIX1Q15475 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SIX1Q15475 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SIX1Q15475 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SIX1Q15475 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SIX1Q15475 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SIX1Q15475 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
SIX1Q15475 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SIX1Q15475 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SIX1Q15475 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SIX1Q15475 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SIX1Q15475 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SIX1Q15475 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SIX1Q15475 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SIX1Q15475 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SIX1Q15475 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SIX1Q15475 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SIX1Q15475 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SIX1Q15475 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SIX1Q15475 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SIX1Q15475 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SIX1Q15475 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SIX1Q15475 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SIX1Q15475 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SIX1Q15475 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SIX1Q15475 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SIX1Q15475 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SIX1Q15475 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SIX1Q15475 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SIX1Q15475 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SIX1Q15475 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SIX1Q15475 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SIX1Q15475 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SIX1Q15475 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
SIX1Q15475 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SIX1Q15475 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SIX1Q15475 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SIX1Q15475 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SIX1Q15475 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SIX1Q15475 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SIX1Q15475 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SIX1Q15475 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SIX1Q15475 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SIX1Q15475 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SIX1Q15475 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
SIX1Q15475 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SIX1Q15475 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SIX1Q15475 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SIX1Q15475 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SIX1Q15475 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SIX1Q15475 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SIX1Q15475 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SIX1Q15475 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SIX1Q15475 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SIX1Q15475 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SIX1Q15475 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SIX1Q15475 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SIX1Q15475 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SIX1Q15475 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SIX1Q15475 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SIX1Q15475 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SIX1Q15475 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SIX1Q15475 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SIX1Q15475 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SIX1Q15475 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SIX1Q15475 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
SIX1Q15475 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SIX1Q15475 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SIX1Q15475 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SIX1Q15475 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SIX1Q15475 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SIX1Q15475 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SIX1Q15475 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SIX1Q15475 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SIX1Q15475 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SIX1Q15475 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SIX1Q15475 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SIX1Q15475 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SIX1Q15475 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
SIX1Q15475 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
SIX1Q15475 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SIX1Q15475 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SIX1Q15475 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SIX1Q15475 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SIX1Q15475 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
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