Protein–RNA interactions for Protein: Q15361

TTF1, Transcription termination factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 905 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTF1Q15361 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TTF1Q15361 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TTF1Q15361 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TTF1Q15361 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TTF1Q15361 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TTF1Q15361 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TTF1Q15361 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
TTF1Q15361 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TTF1Q15361 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TTF1Q15361 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TTF1Q15361 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TTF1Q15361 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TTF1Q15361 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TTF1Q15361 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TTF1Q15361 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TTF1Q15361 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
TTF1Q15361 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TTF1Q15361 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TTF1Q15361 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TTF1Q15361 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TTF1Q15361 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TTF1Q15361 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TTF1Q15361 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TTF1Q15361 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TTF1Q15361 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TTF1Q15361 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TTF1Q15361 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TTF1Q15361 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
TTF1Q15361 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TTF1Q15361 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TTF1Q15361 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TTF1Q15361 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TTF1Q15361 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TTF1Q15361 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TTF1Q15361 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
TTF1Q15361 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TTF1Q15361 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TTF1Q15361 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TTF1Q15361 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TTF1Q15361 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TTF1Q15361 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TTF1Q15361 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TTF1Q15361 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TTF1Q15361 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TTF1Q15361 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TTF1Q15361 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TTF1Q15361 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TTF1Q15361 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TTF1Q15361 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TTF1Q15361 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TTF1Q15361 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
TTF1Q15361 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TTF1Q15361 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TTF1Q15361 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TTF1Q15361 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TTF1Q15361 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
TTF1Q15361 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TTF1Q15361 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TTF1Q15361 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TTF1Q15361 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TTF1Q15361 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TTF1Q15361 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TTF1Q15361 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TTF1Q15361 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TTF1Q15361 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
TTF1Q15361 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TTF1Q15361 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TTF1Q15361 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TTF1Q15361 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TTF1Q15361 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TTF1Q15361 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TTF1Q15361 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TTF1Q15361 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TTF1Q15361 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TTF1Q15361 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TTF1Q15361 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TTF1Q15361 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TTF1Q15361 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TTF1Q15361 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TTF1Q15361 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TTF1Q15361 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
TTF1Q15361 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TTF1Q15361 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC24■■□□□ 1.43
TTF1Q15361 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC24■■□□□ 1.43
TTF1Q15361 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TTF1Q15361 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
TTF1Q15361 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC24■■□□□ 1.43
TTF1Q15361 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TTF1Q15361 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TTF1Q15361 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TTF1Q15361 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
TTF1Q15361 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TTF1Q15361 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TTF1Q15361 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TTF1Q15361 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TTF1Q15361 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TTF1Q15361 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TTF1Q15361 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TTF1Q15361 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TTF1Q15361 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
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