Protein–RNA interactions for Protein: Q15139

PRKD1, Serine/threonine-protein kinase D1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKD1Q15139 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PRKD1Q15139 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PRKD1Q15139 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PRKD1Q15139 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PRKD1Q15139 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PRKD1Q15139 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PRKD1Q15139 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PRKD1Q15139 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PRKD1Q15139 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PRKD1Q15139 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PRKD1Q15139 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PRKD1Q15139 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PRKD1Q15139 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PRKD1Q15139 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PRKD1Q15139 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
PRKD1Q15139 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PRKD1Q15139 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PRKD1Q15139 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PRKD1Q15139 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PRKD1Q15139 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PRKD1Q15139 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PRKD1Q15139 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PRKD1Q15139 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PRKD1Q15139 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PRKD1Q15139 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PRKD1Q15139 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PRKD1Q15139 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PRKD1Q15139 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PRKD1Q15139 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
PRKD1Q15139 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
PRKD1Q15139 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PRKD1Q15139 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PRKD1Q15139 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PRKD1Q15139 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PRKD1Q15139 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PRKD1Q15139 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PRKD1Q15139 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
PRKD1Q15139 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
PRKD1Q15139 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PRKD1Q15139 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
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PRKD1Q15139 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PRKD1Q15139 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
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PRKD1Q15139 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PRKD1Q15139 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PRKD1Q15139 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
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PRKD1Q15139 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PRKD1Q15139 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PRKD1Q15139 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PRKD1Q15139 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PRKD1Q15139 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
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PRKD1Q15139 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PRKD1Q15139 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
PRKD1Q15139 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PRKD1Q15139 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PRKD1Q15139 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PRKD1Q15139 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PRKD1Q15139 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PRKD1Q15139 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PRKD1Q15139 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PRKD1Q15139 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PRKD1Q15139 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PRKD1Q15139 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PRKD1Q15139 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PRKD1Q15139 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PRKD1Q15139 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
PRKD1Q15139 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PRKD1Q15139 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PRKD1Q15139 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PRKD1Q15139 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PRKD1Q15139 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PRKD1Q15139 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PRKD1Q15139 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PRKD1Q15139 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PRKD1Q15139 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PRKD1Q15139 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PRKD1Q15139 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PRKD1Q15139 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PRKD1Q15139 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PRKD1Q15139 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PRKD1Q15139 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PRKD1Q15139 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PRKD1Q15139 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PRKD1Q15139 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PRKD1Q15139 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PRKD1Q15139 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PRKD1Q15139 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PRKD1Q15139 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PRKD1Q15139 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PRKD1Q15139 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PRKD1Q15139 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PRKD1Q15139 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
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