Protein–RNA interactions for Protein: Q15032

R3HDM1, R3H domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,099 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3HDM1Q15032 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
R3HDM1Q15032 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
R3HDM1Q15032 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
R3HDM1Q15032 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
R3HDM1Q15032 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
R3HDM1Q15032 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
R3HDM1Q15032 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
R3HDM1Q15032 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
R3HDM1Q15032 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
R3HDM1Q15032 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
R3HDM1Q15032 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
R3HDM1Q15032 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
R3HDM1Q15032 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
R3HDM1Q15032 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
R3HDM1Q15032 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
R3HDM1Q15032 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
R3HDM1Q15032 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
R3HDM1Q15032 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
R3HDM1Q15032 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
R3HDM1Q15032 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
R3HDM1Q15032 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
R3HDM1Q15032 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
R3HDM1Q15032 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
R3HDM1Q15032 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
R3HDM1Q15032 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
R3HDM1Q15032 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
R3HDM1Q15032 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
R3HDM1Q15032 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
R3HDM1Q15032 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
R3HDM1Q15032 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
R3HDM1Q15032 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
R3HDM1Q15032 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
R3HDM1Q15032 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
R3HDM1Q15032 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
R3HDM1Q15032 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
R3HDM1Q15032 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
R3HDM1Q15032 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
R3HDM1Q15032 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
R3HDM1Q15032 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
R3HDM1Q15032 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
R3HDM1Q15032 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
R3HDM1Q15032 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
R3HDM1Q15032 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC25.32■■□□□ 1.64
R3HDM1Q15032 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
R3HDM1Q15032 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
R3HDM1Q15032 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
R3HDM1Q15032 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
R3HDM1Q15032 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
R3HDM1Q15032 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
R3HDM1Q15032 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
R3HDM1Q15032 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
R3HDM1Q15032 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
R3HDM1Q15032 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
R3HDM1Q15032 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
R3HDM1Q15032 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
R3HDM1Q15032 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
R3HDM1Q15032 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
R3HDM1Q15032 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
R3HDM1Q15032 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
R3HDM1Q15032 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
R3HDM1Q15032 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
R3HDM1Q15032 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
R3HDM1Q15032 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
R3HDM1Q15032 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
R3HDM1Q15032 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
R3HDM1Q15032 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
R3HDM1Q15032 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
R3HDM1Q15032 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
R3HDM1Q15032 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
R3HDM1Q15032 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
R3HDM1Q15032 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
R3HDM1Q15032 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
R3HDM1Q15032 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
R3HDM1Q15032 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
R3HDM1Q15032 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
R3HDM1Q15032 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
R3HDM1Q15032 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
R3HDM1Q15032 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
R3HDM1Q15032 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
R3HDM1Q15032 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
R3HDM1Q15032 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
R3HDM1Q15032 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
R3HDM1Q15032 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
R3HDM1Q15032 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
R3HDM1Q15032 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
R3HDM1Q15032 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
R3HDM1Q15032 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
R3HDM1Q15032 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
R3HDM1Q15032 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
R3HDM1Q15032 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
R3HDM1Q15032 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
R3HDM1Q15032 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
R3HDM1Q15032 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
R3HDM1Q15032 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
R3HDM1Q15032 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
R3HDM1Q15032 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
R3HDM1Q15032 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
R3HDM1Q15032 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
R3HDM1Q15032 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
R3HDM1Q15032 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms