Protein–RNA interactions for Protein: Q149N8

SHPRH, E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH, humanhuman

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Length 1,683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHPRHQ149N8 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SHPRHQ149N8 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SHPRHQ149N8 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SHPRHQ149N8 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SHPRHQ149N8 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SHPRHQ149N8 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SHPRHQ149N8 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SHPRHQ149N8 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SHPRHQ149N8 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SHPRHQ149N8 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SHPRHQ149N8 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SHPRHQ149N8 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SHPRHQ149N8 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SHPRHQ149N8 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SHPRHQ149N8 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SHPRHQ149N8 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
SHPRHQ149N8 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
SHPRHQ149N8 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
SHPRHQ149N8 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
SHPRHQ149N8 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SHPRHQ149N8 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
SHPRHQ149N8 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
SHPRHQ149N8 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SHPRHQ149N8 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SHPRHQ149N8 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SHPRHQ149N8 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SHPRHQ149N8 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SHPRHQ149N8 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SHPRHQ149N8 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SHPRHQ149N8 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SHPRHQ149N8 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SHPRHQ149N8 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SHPRHQ149N8 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SHPRHQ149N8 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SHPRHQ149N8 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SHPRHQ149N8 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SHPRHQ149N8 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SHPRHQ149N8 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SHPRHQ149N8 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SHPRHQ149N8 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SHPRHQ149N8 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SHPRHQ149N8 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SHPRHQ149N8 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SHPRHQ149N8 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SHPRHQ149N8 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SHPRHQ149N8 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SHPRHQ149N8 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
SHPRHQ149N8 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SHPRHQ149N8 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SHPRHQ149N8 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SHPRHQ149N8 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SHPRHQ149N8 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SHPRHQ149N8 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SHPRHQ149N8 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SHPRHQ149N8 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SHPRHQ149N8 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SHPRHQ149N8 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SHPRHQ149N8 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SHPRHQ149N8 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
SHPRHQ149N8 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
SHPRHQ149N8 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SHPRHQ149N8 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SHPRHQ149N8 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SHPRHQ149N8 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SHPRHQ149N8 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SHPRHQ149N8 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SHPRHQ149N8 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SHPRHQ149N8 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SHPRHQ149N8 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SHPRHQ149N8 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SHPRHQ149N8 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
SHPRHQ149N8 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
SHPRHQ149N8 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SHPRHQ149N8 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SHPRHQ149N8 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SHPRHQ149N8 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SHPRHQ149N8 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SHPRHQ149N8 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SHPRHQ149N8 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SHPRHQ149N8 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SHPRHQ149N8 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SHPRHQ149N8 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SHPRHQ149N8 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SHPRHQ149N8 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SHPRHQ149N8 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SHPRHQ149N8 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SHPRHQ149N8 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SHPRHQ149N8 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
SHPRHQ149N8 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SHPRHQ149N8 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SHPRHQ149N8 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SHPRHQ149N8 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SHPRHQ149N8 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SHPRHQ149N8 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SHPRHQ149N8 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SHPRHQ149N8 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SHPRHQ149N8 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SHPRHQ149N8 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SHPRHQ149N8 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SHPRHQ149N8 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
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