Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CHD4Q14839 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CHD4Q14839 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CHD4Q14839 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CHD4Q14839 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CHD4Q14839 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CHD4Q14839 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CHD4Q14839 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
CHD4Q14839 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CHD4Q14839 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CHD4Q14839 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CHD4Q14839 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CHD4Q14839 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CHD4Q14839 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CHD4Q14839 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC25■■□□□ 1.59
CHD4Q14839 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC25■■□□□ 1.59
CHD4Q14839 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CHD4Q14839 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC25■■□□□ 1.59
CHD4Q14839 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC25■■□□□ 1.59
CHD4Q14839 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CHD4Q14839 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CHD4Q14839 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CHD4Q14839 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CHD4Q14839 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CHD4Q14839 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CHD4Q14839 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CHD4Q14839 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CHD4Q14839 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CHD4Q14839 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CHD4Q14839 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CHD4Q14839 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CHD4Q14839 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CHD4Q14839 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CHD4Q14839 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CHD4Q14839 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
CHD4Q14839 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
CHD4Q14839 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CHD4Q14839 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CHD4Q14839 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CHD4Q14839 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CHD4Q14839 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CHD4Q14839 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CHD4Q14839 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CHD4Q14839 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CHD4Q14839 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CHD4Q14839 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CHD4Q14839 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
CHD4Q14839 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CHD4Q14839 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CHD4Q14839 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CHD4Q14839 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CHD4Q14839 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CHD4Q14839 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CHD4Q14839 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CHD4Q14839 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CHD4Q14839 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CHD4Q14839 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CHD4Q14839 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
CHD4Q14839 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CHD4Q14839 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CHD4Q14839 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
CHD4Q14839 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CHD4Q14839 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CHD4Q14839 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
CHD4Q14839 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CHD4Q14839 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CHD4Q14839 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CHD4Q14839 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CHD4Q14839 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CHD4Q14839 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
CHD4Q14839 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CHD4Q14839 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CHD4Q14839 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CHD4Q14839 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CHD4Q14839 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CHD4Q14839 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CHD4Q14839 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CHD4Q14839 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CHD4Q14839 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CHD4Q14839 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CHD4Q14839 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
CHD4Q14839 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CHD4Q14839 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CHD4Q14839 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
CHD4Q14839 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CHD4Q14839 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CHD4Q14839 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CHD4Q14839 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.59
CHD4Q14839 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CHD4Q14839 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CHD4Q14839 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CHD4Q14839 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CHD4Q14839 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
CHD4Q14839 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
CHD4Q14839 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CHD4Q14839 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CHD4Q14839 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CHD4Q14839 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CHD4Q14839 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CHD4Q14839 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
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