Protein–RNA interactions for Protein: Q14699

RFTN1, Raftlin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 578 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN1Q14699 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RFTN1Q14699 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RFTN1Q14699 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RFTN1Q14699 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RFTN1Q14699 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RFTN1Q14699 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RFTN1Q14699 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RFTN1Q14699 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RFTN1Q14699 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RFTN1Q14699 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RFTN1Q14699 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RFTN1Q14699 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RFTN1Q14699 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
RFTN1Q14699 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
RFTN1Q14699 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RFTN1Q14699 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RFTN1Q14699 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RFTN1Q14699 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RFTN1Q14699 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RFTN1Q14699 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RFTN1Q14699 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RFTN1Q14699 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RFTN1Q14699 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RFTN1Q14699 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RFTN1Q14699 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RFTN1Q14699 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RFTN1Q14699 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RFTN1Q14699 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RFTN1Q14699 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RFTN1Q14699 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RFTN1Q14699 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RFTN1Q14699 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RFTN1Q14699 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RFTN1Q14699 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RFTN1Q14699 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RFTN1Q14699 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
RFTN1Q14699 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RFTN1Q14699 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RFTN1Q14699 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RFTN1Q14699 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RFTN1Q14699 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RFTN1Q14699 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
RFTN1Q14699 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RFTN1Q14699 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RFTN1Q14699 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RFTN1Q14699 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RFTN1Q14699 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RFTN1Q14699 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RFTN1Q14699 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RFTN1Q14699 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RFTN1Q14699 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RFTN1Q14699 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RFTN1Q14699 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RFTN1Q14699 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
RFTN1Q14699 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RFTN1Q14699 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RFTN1Q14699 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RFTN1Q14699 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RFTN1Q14699 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RFTN1Q14699 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RFTN1Q14699 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RFTN1Q14699 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RFTN1Q14699 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RFTN1Q14699 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RFTN1Q14699 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RFTN1Q14699 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RFTN1Q14699 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RFTN1Q14699 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RFTN1Q14699 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RFTN1Q14699 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RFTN1Q14699 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RFTN1Q14699 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RFTN1Q14699 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RFTN1Q14699 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RFTN1Q14699 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RFTN1Q14699 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
RFTN1Q14699 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RFTN1Q14699 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RFTN1Q14699 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RFTN1Q14699 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
RFTN1Q14699 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
RFTN1Q14699 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
RFTN1Q14699 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RFTN1Q14699 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RFTN1Q14699 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RFTN1Q14699 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RFTN1Q14699 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RFTN1Q14699 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RFTN1Q14699 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RFTN1Q14699 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RFTN1Q14699 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RFTN1Q14699 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RFTN1Q14699 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RFTN1Q14699 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RFTN1Q14699 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RFTN1Q14699 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RFTN1Q14699 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RFTN1Q14699 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RFTN1Q14699 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RFTN1Q14699 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
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