Protein–RNA interactions for Protein: Q14534

SQLE, Squalene monooxygenase, humanhuman

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Length 574 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SQLEQ14534 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SQLEQ14534 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SQLEQ14534 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SQLEQ14534 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SQLEQ14534 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SQLEQ14534 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SQLEQ14534 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SQLEQ14534 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
SQLEQ14534 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SQLEQ14534 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SQLEQ14534 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SQLEQ14534 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SQLEQ14534 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SQLEQ14534 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SQLEQ14534 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SQLEQ14534 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SQLEQ14534 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SQLEQ14534 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SQLEQ14534 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SQLEQ14534 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SQLEQ14534 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SQLEQ14534 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SQLEQ14534 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SQLEQ14534 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SQLEQ14534 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SQLEQ14534 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SQLEQ14534 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SQLEQ14534 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SQLEQ14534 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SQLEQ14534 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SQLEQ14534 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SQLEQ14534 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SQLEQ14534 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SQLEQ14534 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SQLEQ14534 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SQLEQ14534 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SQLEQ14534 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SQLEQ14534 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SQLEQ14534 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SQLEQ14534 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SQLEQ14534 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SQLEQ14534 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SQLEQ14534 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SQLEQ14534 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SQLEQ14534 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SQLEQ14534 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SQLEQ14534 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SQLEQ14534 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SQLEQ14534 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SQLEQ14534 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SQLEQ14534 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SQLEQ14534 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SQLEQ14534 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SQLEQ14534 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SQLEQ14534 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SQLEQ14534 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SQLEQ14534 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SQLEQ14534 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SQLEQ14534 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SQLEQ14534 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SQLEQ14534 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SQLEQ14534 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SQLEQ14534 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SQLEQ14534 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SQLEQ14534 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SQLEQ14534 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
SQLEQ14534 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SQLEQ14534 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SQLEQ14534 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SQLEQ14534 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SQLEQ14534 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SQLEQ14534 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SQLEQ14534 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SQLEQ14534 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SQLEQ14534 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SQLEQ14534 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SQLEQ14534 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SQLEQ14534 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SQLEQ14534 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SQLEQ14534 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SQLEQ14534 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SQLEQ14534 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SQLEQ14534 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SQLEQ14534 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SQLEQ14534 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SQLEQ14534 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SQLEQ14534 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SQLEQ14534 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SQLEQ14534 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SQLEQ14534 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SQLEQ14534 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SQLEQ14534 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
SQLEQ14534 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SQLEQ14534 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SQLEQ14534 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SQLEQ14534 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
SQLEQ14534 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SQLEQ14534 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SQLEQ14534 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SQLEQ14534 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
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