Protein–RNA interactions for Protein: Q14152

EIF3A, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,382 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF3AQ14152 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
EIF3AQ14152 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
EIF3AQ14152 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
EIF3AQ14152 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
EIF3AQ14152 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
EIF3AQ14152 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
EIF3AQ14152 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
EIF3AQ14152 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
EIF3AQ14152 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
EIF3AQ14152 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
EIF3AQ14152 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
EIF3AQ14152 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
EIF3AQ14152 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
EIF3AQ14152 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC28■■■□□ 2.07
EIF3AQ14152 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
EIF3AQ14152 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
EIF3AQ14152 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
EIF3AQ14152 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
EIF3AQ14152 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
EIF3AQ14152 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
EIF3AQ14152 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC28■■■□□ 2.07
EIF3AQ14152 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
EIF3AQ14152 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
EIF3AQ14152 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
EIF3AQ14152 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC28■■■□□ 2.07
EIF3AQ14152 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
EIF3AQ14152 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
EIF3AQ14152 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
EIF3AQ14152 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
EIF3AQ14152 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
EIF3AQ14152 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
EIF3AQ14152 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
EIF3AQ14152 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
EIF3AQ14152 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
EIF3AQ14152 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
EIF3AQ14152 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
EIF3AQ14152 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
EIF3AQ14152 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
EIF3AQ14152 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
EIF3AQ14152 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
EIF3AQ14152 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
EIF3AQ14152 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
EIF3AQ14152 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
EIF3AQ14152 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
EIF3AQ14152 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
EIF3AQ14152 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
EIF3AQ14152 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
EIF3AQ14152 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
EIF3AQ14152 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
EIF3AQ14152 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
EIF3AQ14152 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
EIF3AQ14152 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
EIF3AQ14152 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
EIF3AQ14152 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
EIF3AQ14152 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
EIF3AQ14152 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
EIF3AQ14152 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
EIF3AQ14152 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
EIF3AQ14152 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
EIF3AQ14152 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
EIF3AQ14152 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
EIF3AQ14152 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
EIF3AQ14152 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
EIF3AQ14152 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
EIF3AQ14152 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
EIF3AQ14152 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
EIF3AQ14152 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
EIF3AQ14152 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC27.97■■■□□ 2.07
EIF3AQ14152 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
EIF3AQ14152 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
EIF3AQ14152 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
EIF3AQ14152 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
EIF3AQ14152 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
EIF3AQ14152 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
EIF3AQ14152 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
EIF3AQ14152 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
EIF3AQ14152 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
EIF3AQ14152 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
EIF3AQ14152 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
EIF3AQ14152 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
EIF3AQ14152 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
EIF3AQ14152 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
EIF3AQ14152 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
EIF3AQ14152 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
EIF3AQ14152 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
EIF3AQ14152 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
EIF3AQ14152 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
EIF3AQ14152 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
EIF3AQ14152 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
EIF3AQ14152 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
EIF3AQ14152 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
EIF3AQ14152 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
EIF3AQ14152 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
EIF3AQ14152 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
EIF3AQ14152 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
EIF3AQ14152 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
EIF3AQ14152 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
EIF3AQ14152 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
EIF3AQ14152 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
EIF3AQ14152 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms