Protein–RNA interactions for Protein: Q14050

COL9A3, Collagen alpha-3(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 684 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A3Q14050 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
COL9A3Q14050 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
COL9A3Q14050 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
COL9A3Q14050 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
COL9A3Q14050 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
COL9A3Q14050 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
COL9A3Q14050 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
COL9A3Q14050 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
COL9A3Q14050 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
COL9A3Q14050 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
COL9A3Q14050 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
COL9A3Q14050 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
COL9A3Q14050 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
COL9A3Q14050 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
COL9A3Q14050 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
COL9A3Q14050 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
COL9A3Q14050 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
COL9A3Q14050 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
COL9A3Q14050 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
COL9A3Q14050 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
COL9A3Q14050 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
COL9A3Q14050 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
COL9A3Q14050 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
COL9A3Q14050 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
COL9A3Q14050 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
COL9A3Q14050 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
COL9A3Q14050 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
COL9A3Q14050 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
COL9A3Q14050 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
COL9A3Q14050 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
COL9A3Q14050 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
COL9A3Q14050 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
COL9A3Q14050 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
COL9A3Q14050 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
COL9A3Q14050 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
COL9A3Q14050 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
COL9A3Q14050 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
COL9A3Q14050 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
COL9A3Q14050 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
COL9A3Q14050 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
COL9A3Q14050 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
COL9A3Q14050 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
COL9A3Q14050 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
COL9A3Q14050 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
COL9A3Q14050 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
COL9A3Q14050 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
COL9A3Q14050 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
COL9A3Q14050 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
COL9A3Q14050 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
COL9A3Q14050 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
COL9A3Q14050 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
COL9A3Q14050 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
COL9A3Q14050 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
COL9A3Q14050 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
COL9A3Q14050 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
COL9A3Q14050 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
COL9A3Q14050 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
COL9A3Q14050 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
COL9A3Q14050 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
COL9A3Q14050 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
COL9A3Q14050 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
COL9A3Q14050 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
COL9A3Q14050 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
COL9A3Q14050 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
COL9A3Q14050 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
COL9A3Q14050 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
COL9A3Q14050 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
COL9A3Q14050 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
COL9A3Q14050 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
COL9A3Q14050 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
COL9A3Q14050 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
COL9A3Q14050 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
COL9A3Q14050 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
COL9A3Q14050 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
COL9A3Q14050 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
COL9A3Q14050 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
COL9A3Q14050 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
COL9A3Q14050 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
COL9A3Q14050 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
COL9A3Q14050 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
COL9A3Q14050 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
COL9A3Q14050 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
COL9A3Q14050 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
COL9A3Q14050 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
COL9A3Q14050 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
COL9A3Q14050 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
COL9A3Q14050 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
COL9A3Q14050 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
COL9A3Q14050 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
COL9A3Q14050 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
COL9A3Q14050 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
COL9A3Q14050 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
COL9A3Q14050 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
COL9A3Q14050 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
COL9A3Q14050 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
COL9A3Q14050 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
COL9A3Q14050 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
COL9A3Q14050 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
COL9A3Q14050 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
COL9A3Q14050 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
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