Protein–RNA interactions for Protein: Q14031

COL4A6, Collagen alpha-6(IV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,691 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A6Q14031 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
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COL4A6Q14031 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
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COL4A6Q14031 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
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COL4A6Q14031 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
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COL4A6Q14031 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
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COL4A6Q14031 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
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COL4A6Q14031 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
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COL4A6Q14031 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
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COL4A6Q14031 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
COL4A6Q14031 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
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COL4A6Q14031 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
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COL4A6Q14031 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
COL4A6Q14031 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
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