Protein–RNA interactions for Protein: Q13790

APOF, Apolipoprotein F, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOFQ13790 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
APOFQ13790 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
APOFQ13790 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
APOFQ13790 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
APOFQ13790 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
APOFQ13790 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
APOFQ13790 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
APOFQ13790 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
APOFQ13790 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
APOFQ13790 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
APOFQ13790 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
APOFQ13790 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
APOFQ13790 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
APOFQ13790 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
APOFQ13790 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
APOFQ13790 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
APOFQ13790 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
APOFQ13790 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
APOFQ13790 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
APOFQ13790 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
APOFQ13790 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
APOFQ13790 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
APOFQ13790 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
APOFQ13790 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
APOFQ13790 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
APOFQ13790 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
APOFQ13790 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
APOFQ13790 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
APOFQ13790 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
APOFQ13790 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
APOFQ13790 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
APOFQ13790 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
APOFQ13790 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
APOFQ13790 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
APOFQ13790 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
APOFQ13790 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
APOFQ13790 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
APOFQ13790 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
APOFQ13790 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
APOFQ13790 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
APOFQ13790 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
APOFQ13790 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
APOFQ13790 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
APOFQ13790 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
APOFQ13790 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
APOFQ13790 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
APOFQ13790 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
APOFQ13790 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
APOFQ13790 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
APOFQ13790 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
APOFQ13790 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
APOFQ13790 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
APOFQ13790 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
APOFQ13790 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
APOFQ13790 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
APOFQ13790 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
APOFQ13790 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
APOFQ13790 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
APOFQ13790 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
APOFQ13790 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
APOFQ13790 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
APOFQ13790 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
APOFQ13790 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
APOFQ13790 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
APOFQ13790 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
APOFQ13790 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
APOFQ13790 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
APOFQ13790 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
APOFQ13790 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
APOFQ13790 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
APOFQ13790 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
APOFQ13790 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
APOFQ13790 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
APOFQ13790 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
APOFQ13790 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
APOFQ13790 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
APOFQ13790 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
APOFQ13790 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
APOFQ13790 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
APOFQ13790 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
APOFQ13790 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
APOFQ13790 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
APOFQ13790 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
APOFQ13790 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
APOFQ13790 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
APOFQ13790 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
APOFQ13790 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
APOFQ13790 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
APOFQ13790 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
APOFQ13790 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
APOFQ13790 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
APOFQ13790 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
APOFQ13790 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
APOFQ13790 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
APOFQ13790 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
APOFQ13790 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
APOFQ13790 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
APOFQ13790 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
APOFQ13790 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
APOFQ13790 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
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