Protein–RNA interactions for Protein: Q13740

ALCAM, CD166 antigen, humanhuman

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Length 583 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALCAMQ13740 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ALCAMQ13740 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
ALCAMQ13740 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ALCAMQ13740 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ALCAMQ13740 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ALCAMQ13740 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ALCAMQ13740 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ALCAMQ13740 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ALCAMQ13740 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ALCAMQ13740 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ALCAMQ13740 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ALCAMQ13740 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ALCAMQ13740 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ALCAMQ13740 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ALCAMQ13740 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ALCAMQ13740 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ALCAMQ13740 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ALCAMQ13740 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ALCAMQ13740 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ALCAMQ13740 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ALCAMQ13740 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ALCAMQ13740 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ALCAMQ13740 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ALCAMQ13740 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ALCAMQ13740 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ALCAMQ13740 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ALCAMQ13740 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ALCAMQ13740 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ALCAMQ13740 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ALCAMQ13740 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ALCAMQ13740 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
ALCAMQ13740 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ALCAMQ13740 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ALCAMQ13740 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
ALCAMQ13740 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ALCAMQ13740 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ALCAMQ13740 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ALCAMQ13740 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ALCAMQ13740 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ALCAMQ13740 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ALCAMQ13740 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ALCAMQ13740 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ALCAMQ13740 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ALCAMQ13740 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ALCAMQ13740 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ALCAMQ13740 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ALCAMQ13740 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ALCAMQ13740 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ALCAMQ13740 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ALCAMQ13740 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
ALCAMQ13740 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
ALCAMQ13740 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ALCAMQ13740 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ALCAMQ13740 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ALCAMQ13740 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ALCAMQ13740 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ALCAMQ13740 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ALCAMQ13740 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ALCAMQ13740 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ALCAMQ13740 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ALCAMQ13740 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
ALCAMQ13740 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ALCAMQ13740 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ALCAMQ13740 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ALCAMQ13740 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ALCAMQ13740 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ALCAMQ13740 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ALCAMQ13740 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ALCAMQ13740 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ALCAMQ13740 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ALCAMQ13740 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ALCAMQ13740 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ALCAMQ13740 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ALCAMQ13740 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ALCAMQ13740 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ALCAMQ13740 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ALCAMQ13740 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ALCAMQ13740 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ALCAMQ13740 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
ALCAMQ13740 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ALCAMQ13740 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ALCAMQ13740 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ALCAMQ13740 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ALCAMQ13740 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
ALCAMQ13740 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ALCAMQ13740 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ALCAMQ13740 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ALCAMQ13740 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ALCAMQ13740 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ALCAMQ13740 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ALCAMQ13740 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ALCAMQ13740 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ALCAMQ13740 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ALCAMQ13740 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ALCAMQ13740 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ALCAMQ13740 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ALCAMQ13740 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ALCAMQ13740 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ALCAMQ13740 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ALCAMQ13740 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
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