Protein–RNA interactions for Protein: Q13541

EIF4EBP1, Eukaryotic translation initiation factor 4E-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF4EBP1Q13541 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EIF4EBP1Q13541 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EIF4EBP1Q13541 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EIF4EBP1Q13541 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
EIF4EBP1Q13541 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EIF4EBP1Q13541 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EIF4EBP1Q13541 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EIF4EBP1Q13541 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
EIF4EBP1Q13541 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
EIF4EBP1Q13541 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
EIF4EBP1Q13541 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
EIF4EBP1Q13541 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
EIF4EBP1Q13541 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
EIF4EBP1Q13541 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
EIF4EBP1Q13541 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EIF4EBP1Q13541 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EIF4EBP1Q13541 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
EIF4EBP1Q13541 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EIF4EBP1Q13541 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EIF4EBP1Q13541 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
EIF4EBP1Q13541 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EIF4EBP1Q13541 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EIF4EBP1Q13541 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EIF4EBP1Q13541 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
EIF4EBP1Q13541 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
EIF4EBP1Q13541 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
EIF4EBP1Q13541 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
EIF4EBP1Q13541 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EIF4EBP1Q13541 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EIF4EBP1Q13541 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EIF4EBP1Q13541 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EIF4EBP1Q13541 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EIF4EBP1Q13541 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EIF4EBP1Q13541 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EIF4EBP1Q13541 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EIF4EBP1Q13541 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EIF4EBP1Q13541 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EIF4EBP1Q13541 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EIF4EBP1Q13541 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EIF4EBP1Q13541 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EIF4EBP1Q13541 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EIF4EBP1Q13541 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EIF4EBP1Q13541 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EIF4EBP1Q13541 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
EIF4EBP1Q13541 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
EIF4EBP1Q13541 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EIF4EBP1Q13541 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EIF4EBP1Q13541 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EIF4EBP1Q13541 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EIF4EBP1Q13541 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EIF4EBP1Q13541 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EIF4EBP1Q13541 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EIF4EBP1Q13541 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EIF4EBP1Q13541 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
EIF4EBP1Q13541 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
EIF4EBP1Q13541 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EIF4EBP1Q13541 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EIF4EBP1Q13541 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
EIF4EBP1Q13541 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EIF4EBP1Q13541 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EIF4EBP1Q13541 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EIF4EBP1Q13541 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EIF4EBP1Q13541 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EIF4EBP1Q13541 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EIF4EBP1Q13541 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EIF4EBP1Q13541 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EIF4EBP1Q13541 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EIF4EBP1Q13541 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EIF4EBP1Q13541 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EIF4EBP1Q13541 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EIF4EBP1Q13541 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EIF4EBP1Q13541 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EIF4EBP1Q13541 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EIF4EBP1Q13541 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EIF4EBP1Q13541 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EIF4EBP1Q13541 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EIF4EBP1Q13541 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EIF4EBP1Q13541 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EIF4EBP1Q13541 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EIF4EBP1Q13541 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EIF4EBP1Q13541 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
EIF4EBP1Q13541 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EIF4EBP1Q13541 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
EIF4EBP1Q13541 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EIF4EBP1Q13541 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
EIF4EBP1Q13541 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EIF4EBP1Q13541 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EIF4EBP1Q13541 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EIF4EBP1Q13541 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EIF4EBP1Q13541 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EIF4EBP1Q13541 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EIF4EBP1Q13541 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EIF4EBP1Q13541 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EIF4EBP1Q13541 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EIF4EBP1Q13541 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EIF4EBP1Q13541 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EIF4EBP1Q13541 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EIF4EBP1Q13541 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EIF4EBP1Q13541 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EIF4EBP1Q13541 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms