Protein–RNA interactions for Protein: Q13536

C1orf61, Protein CROC-4, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf61Q13536 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
C1orf61Q13536 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
C1orf61Q13536 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
C1orf61Q13536 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
C1orf61Q13536 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
C1orf61Q13536 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
C1orf61Q13536 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
C1orf61Q13536 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
C1orf61Q13536 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
C1orf61Q13536 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
C1orf61Q13536 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
C1orf61Q13536 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
C1orf61Q13536 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
C1orf61Q13536 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
C1orf61Q13536 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
C1orf61Q13536 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
C1orf61Q13536 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
C1orf61Q13536 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
C1orf61Q13536 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
C1orf61Q13536 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
C1orf61Q13536 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
C1orf61Q13536 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
C1orf61Q13536 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
C1orf61Q13536 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
C1orf61Q13536 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
C1orf61Q13536 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
C1orf61Q13536 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
C1orf61Q13536 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
C1orf61Q13536 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
C1orf61Q13536 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
C1orf61Q13536 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
C1orf61Q13536 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
C1orf61Q13536 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
C1orf61Q13536 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
C1orf61Q13536 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
C1orf61Q13536 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
C1orf61Q13536 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
C1orf61Q13536 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
C1orf61Q13536 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
C1orf61Q13536 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
C1orf61Q13536 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
C1orf61Q13536 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
C1orf61Q13536 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
C1orf61Q13536 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
C1orf61Q13536 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
C1orf61Q13536 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
C1orf61Q13536 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
C1orf61Q13536 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
C1orf61Q13536 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
C1orf61Q13536 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
C1orf61Q13536 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
C1orf61Q13536 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
C1orf61Q13536 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
C1orf61Q13536 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
C1orf61Q13536 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
C1orf61Q13536 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
C1orf61Q13536 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
C1orf61Q13536 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
C1orf61Q13536 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
C1orf61Q13536 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
C1orf61Q13536 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
C1orf61Q13536 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
C1orf61Q13536 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
C1orf61Q13536 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
C1orf61Q13536 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
C1orf61Q13536 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
C1orf61Q13536 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
C1orf61Q13536 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
C1orf61Q13536 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
C1orf61Q13536 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
C1orf61Q13536 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
C1orf61Q13536 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
C1orf61Q13536 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
C1orf61Q13536 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
C1orf61Q13536 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
C1orf61Q13536 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
C1orf61Q13536 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
C1orf61Q13536 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
C1orf61Q13536 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
C1orf61Q13536 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
C1orf61Q13536 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
C1orf61Q13536 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
C1orf61Q13536 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
C1orf61Q13536 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
C1orf61Q13536 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
C1orf61Q13536 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
C1orf61Q13536 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
C1orf61Q13536 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
C1orf61Q13536 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
C1orf61Q13536 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
C1orf61Q13536 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC19.46■□□□□ 0.71
C1orf61Q13536 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
C1orf61Q13536 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
C1orf61Q13536 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
C1orf61Q13536 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
C1orf61Q13536 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
C1orf61Q13536 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
C1orf61Q13536 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
C1orf61Q13536 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
C1orf61Q13536 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
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