Protein–RNA interactions for Protein: Q13535

ATR, Serine/threonine-protein kinase ATR, humanhuman

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Length 2,644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRQ13535 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATRQ13535 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATRQ13535 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATRQ13535 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATRQ13535 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATRQ13535 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATRQ13535 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATRQ13535 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATRQ13535 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATRQ13535 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATRQ13535 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATRQ13535 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATRQ13535 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATRQ13535 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATRQ13535 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATRQ13535 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATRQ13535 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATRQ13535 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATRQ13535 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATRQ13535 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATRQ13535 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATRQ13535 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATRQ13535 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATRQ13535 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATRQ13535 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ATRQ13535 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ATRQ13535 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATRQ13535 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ATRQ13535 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATRQ13535 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATRQ13535 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATRQ13535 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATRQ13535 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATRQ13535 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATRQ13535 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ATRQ13535 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATRQ13535 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ATRQ13535 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATRQ13535 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATRQ13535 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ATRQ13535 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ATRQ13535 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ATRQ13535 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ATRQ13535 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ATRQ13535 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ATRQ13535 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ATRQ13535 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ATRQ13535 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ATRQ13535 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ATRQ13535 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
ATRQ13535 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ATRQ13535 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ATRQ13535 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ATRQ13535 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATRQ13535 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATRQ13535 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATRQ13535 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATRQ13535 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATRQ13535 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATRQ13535 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATRQ13535 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATRQ13535 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATRQ13535 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATRQ13535 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATRQ13535 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATRQ13535 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATRQ13535 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATRQ13535 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATRQ13535 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATRQ13535 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATRQ13535 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATRQ13535 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATRQ13535 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATRQ13535 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATRQ13535 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATRQ13535 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATRQ13535 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ATRQ13535 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ATRQ13535 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATRQ13535 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ATRQ13535 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ATRQ13535 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATRQ13535 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATRQ13535 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATRQ13535 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATRQ13535 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATRQ13535 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATRQ13535 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATRQ13535 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATRQ13535 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATRQ13535 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATRQ13535 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATRQ13535 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATRQ13535 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATRQ13535 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATRQ13535 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATRQ13535 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATRQ13535 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATRQ13535 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATRQ13535 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
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