Protein–RNA interactions for Protein: Q13428

TCOF1, Treacle protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCOF1Q13428 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
TCOF1Q13428 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC30.21■■■□□ 2.43
TCOF1Q13428 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
TCOF1Q13428 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
TCOF1Q13428 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
TCOF1Q13428 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
TCOF1Q13428 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
TCOF1Q13428 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
TCOF1Q13428 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC30.21■■■□□ 2.43
TCOF1Q13428 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
TCOF1Q13428 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
TCOF1Q13428 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
TCOF1Q13428 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC30.2■■■□□ 2.43
TCOF1Q13428 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC30.2■■■□□ 2.43
TCOF1Q13428 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
TCOF1Q13428 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
TCOF1Q13428 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
TCOF1Q13428 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
TCOF1Q13428 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
TCOF1Q13428 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
TCOF1Q13428 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
TCOF1Q13428 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC30.19■■■□□ 2.42
TCOF1Q13428 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
TCOF1Q13428 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
TCOF1Q13428 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
TCOF1Q13428 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
TCOF1Q13428 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
TCOF1Q13428 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
TCOF1Q13428 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
TCOF1Q13428 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
TCOF1Q13428 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
TCOF1Q13428 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
TCOF1Q13428 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
TCOF1Q13428 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
TCOF1Q13428 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
TCOF1Q13428 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
TCOF1Q13428 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
TCOF1Q13428 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
TCOF1Q13428 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
TCOF1Q13428 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
TCOF1Q13428 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
TCOF1Q13428 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
TCOF1Q13428 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
TCOF1Q13428 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
TCOF1Q13428 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
TCOF1Q13428 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC30.18■■■□□ 2.42
TCOF1Q13428 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
TCOF1Q13428 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC30.18■■■□□ 2.42
TCOF1Q13428 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC30.17■■■□□ 2.42
TCOF1Q13428 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
TCOF1Q13428 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
TCOF1Q13428 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
TCOF1Q13428 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
TCOF1Q13428 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC30.17■■■□□ 2.42
TCOF1Q13428 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
TCOF1Q13428 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
TCOF1Q13428 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
TCOF1Q13428 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
TCOF1Q13428 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
TCOF1Q13428 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
TCOF1Q13428 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
TCOF1Q13428 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
TCOF1Q13428 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
TCOF1Q13428 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
TCOF1Q13428 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
TCOF1Q13428 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.16■■■□□ 2.42
TCOF1Q13428 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC30.16■■■□□ 2.42
TCOF1Q13428 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
TCOF1Q13428 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
TCOF1Q13428 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
TCOF1Q13428 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
TCOF1Q13428 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
TCOF1Q13428 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
TCOF1Q13428 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
TCOF1Q13428 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
TCOF1Q13428 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
TCOF1Q13428 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC30.14■■■□□ 2.42
TCOF1Q13428 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
TCOF1Q13428 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC30.14■■■□□ 2.42
TCOF1Q13428 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC30.14■■■□□ 2.42
TCOF1Q13428 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC30.14■■■□□ 2.42
TCOF1Q13428 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC30.14■■■□□ 2.42
TCOF1Q13428 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
TCOF1Q13428 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
TCOF1Q13428 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
TCOF1Q13428 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
TCOF1Q13428 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
TCOF1Q13428 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
TCOF1Q13428 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
TCOF1Q13428 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
TCOF1Q13428 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
TCOF1Q13428 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
TCOF1Q13428 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
TCOF1Q13428 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
TCOF1Q13428 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC30.13■■■□□ 2.41
TCOF1Q13428 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
TCOF1Q13428 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
TCOF1Q13428 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
TCOF1Q13428 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
TCOF1Q13428 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
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