Protein–RNA interactions for Protein: Q13421

MSLN, Mesothelin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 630 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSLNQ13421 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
MSLNQ13421 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MSLNQ13421 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
MSLNQ13421 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
MSLNQ13421 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MSLNQ13421 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MSLNQ13421 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MSLNQ13421 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MSLNQ13421 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MSLNQ13421 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MSLNQ13421 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MSLNQ13421 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MSLNQ13421 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MSLNQ13421 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MSLNQ13421 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MSLNQ13421 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MSLNQ13421 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MSLNQ13421 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
MSLNQ13421 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MSLNQ13421 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MSLNQ13421 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MSLNQ13421 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MSLNQ13421 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
MSLNQ13421 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MSLNQ13421 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MSLNQ13421 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MSLNQ13421 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MSLNQ13421 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MSLNQ13421 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MSLNQ13421 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MSLNQ13421 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MSLNQ13421 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MSLNQ13421 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MSLNQ13421 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MSLNQ13421 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MSLNQ13421 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MSLNQ13421 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MSLNQ13421 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MSLNQ13421 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MSLNQ13421 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MSLNQ13421 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MSLNQ13421 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MSLNQ13421 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MSLNQ13421 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MSLNQ13421 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MSLNQ13421 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MSLNQ13421 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MSLNQ13421 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MSLNQ13421 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MSLNQ13421 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MSLNQ13421 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MSLNQ13421 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MSLNQ13421 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MSLNQ13421 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MSLNQ13421 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MSLNQ13421 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MSLNQ13421 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
MSLNQ13421 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MSLNQ13421 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MSLNQ13421 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MSLNQ13421 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MSLNQ13421 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MSLNQ13421 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
MSLNQ13421 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MSLNQ13421 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MSLNQ13421 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MSLNQ13421 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MSLNQ13421 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MSLNQ13421 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MSLNQ13421 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MSLNQ13421 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MSLNQ13421 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MSLNQ13421 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MSLNQ13421 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MSLNQ13421 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MSLNQ13421 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MSLNQ13421 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
MSLNQ13421 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
MSLNQ13421 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MSLNQ13421 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MSLNQ13421 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MSLNQ13421 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MSLNQ13421 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MSLNQ13421 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MSLNQ13421 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MSLNQ13421 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
MSLNQ13421 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MSLNQ13421 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MSLNQ13421 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MSLNQ13421 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MSLNQ13421 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MSLNQ13421 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MSLNQ13421 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MSLNQ13421 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MSLNQ13421 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MSLNQ13421 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MSLNQ13421 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MSLNQ13421 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MSLNQ13421 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MSLNQ13421 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
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