Protein–RNA interactions for Protein: Q13084

MRPL28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL28Q13084 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
MRPL28Q13084 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
MRPL28Q13084 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
MRPL28Q13084 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
MRPL28Q13084 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
MRPL28Q13084 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
MRPL28Q13084 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
MRPL28Q13084 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
MRPL28Q13084 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
MRPL28Q13084 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
MRPL28Q13084 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
MRPL28Q13084 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
MRPL28Q13084 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
MRPL28Q13084 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
MRPL28Q13084 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
MRPL28Q13084 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
MRPL28Q13084 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
MRPL28Q13084 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
MRPL28Q13084 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
MRPL28Q13084 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
MRPL28Q13084 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
MRPL28Q13084 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
MRPL28Q13084 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
MRPL28Q13084 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
MRPL28Q13084 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
MRPL28Q13084 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
MRPL28Q13084 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
MRPL28Q13084 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
MRPL28Q13084 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
MRPL28Q13084 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
MRPL28Q13084 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
MRPL28Q13084 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
MRPL28Q13084 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
MRPL28Q13084 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
MRPL28Q13084 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
MRPL28Q13084 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
MRPL28Q13084 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
MRPL28Q13084 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
MRPL28Q13084 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
MRPL28Q13084 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
MRPL28Q13084 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
MRPL28Q13084 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
MRPL28Q13084 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
MRPL28Q13084 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
MRPL28Q13084 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
MRPL28Q13084 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
MRPL28Q13084 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
MRPL28Q13084 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
MRPL28Q13084 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
MRPL28Q13084 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
MRPL28Q13084 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
MRPL28Q13084 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
MRPL28Q13084 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
MRPL28Q13084 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
MRPL28Q13084 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
MRPL28Q13084 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
MRPL28Q13084 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
MRPL28Q13084 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
MRPL28Q13084 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
MRPL28Q13084 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
MRPL28Q13084 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
MRPL28Q13084 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
MRPL28Q13084 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
MRPL28Q13084 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
MRPL28Q13084 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
MRPL28Q13084 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
MRPL28Q13084 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
MRPL28Q13084 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
MRPL28Q13084 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
MRPL28Q13084 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
MRPL28Q13084 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
MRPL28Q13084 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
MRPL28Q13084 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
MRPL28Q13084 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
MRPL28Q13084 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
MRPL28Q13084 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
MRPL28Q13084 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
MRPL28Q13084 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
MRPL28Q13084 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
MRPL28Q13084 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
MRPL28Q13084 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
MRPL28Q13084 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
MRPL28Q13084 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
MRPL28Q13084 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
MRPL28Q13084 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MRPL28Q13084 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MRPL28Q13084 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MRPL28Q13084 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
MRPL28Q13084 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
MRPL28Q13084 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
MRPL28Q13084 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
MRPL28Q13084 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
MRPL28Q13084 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MRPL28Q13084 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MRPL28Q13084 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MRPL28Q13084 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
MRPL28Q13084 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
MRPL28Q13084 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MRPL28Q13084 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MRPL28Q13084 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
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